在癌症基因组排序的司机乘客

突变在癌症基因组的一项新的研究表明,研究人员可以开始区分“司机”突变,促使细胞癌症“乘客”突变的癌细胞发展的副产品。研究还表明,至少有九分之一没有杀死人体细胞基因可以删除。

充斥着许多的癌症基因突变。绝大多数的这些可能是乘客——突变,导致癌症的发展,但没有发生在癌症的发展,而少数司机是至关重要的。有效的挑战挑选有罪的司机提供的巨大的识别游行组异常中发现癌症基因组尚未完全回答。

“至关重要的是,我们可以区分司机和乘客知道司机因为基因突变,因此关键是导致细胞过程的理解在癌症颠覆,因此新药,”迈克Stratton教授说,这项研究的资深作者从维尔康姆基金会桑格研究所。“我们的研究提供了一个例子,研究人员如何筛选大量的特定类型的突变在癌症基因组为了区分司机和乘客。”

一类癌症基因,称为肿瘤抑制基因抑制肿瘤形成,作为制动过程。这种类型的基因必须灭活或删除从癌细胞的基因组为了释放刹车,让癌症发展。肿瘤抑制基因失去活性的过程通常需要删除的癌症基因的两个副本(一份最初继承了母亲和一个父亲)。因此,在过去找到地区哪些基因的两个副本删除在许多癌症病例已经被证明是一个卓有成效的方式,确定新的肿瘤抑制基因的位置。

问题是,一个基因的两个副本也可以经常从癌症的地区称为脆弱的网站删除。底层的DNA结构脆弱的网站似乎让他们特别容易破损,因此从癌症基因组被抛弃。删除在脆弱的网站,大多数时候,可能是乘客。因此面临的挑战是如何区分乘客删除在脆弱的网站和司机在肿瘤抑制基因缺失。

“我们分析了近750癌症细胞样本已知的肿瘤抑制基因的缺失和比较他们在脆弱的网站,删除“格雷厄姆Bignell博士解释说,该论文的第一作者。“我们发现明显差异的两个让我们构建的“签名”缺失与肿瘤抑制基因和相关签名与脆弱的网站。”

然后使用这些作者签名看删除,他们发现在癌症目前无法解释的。三个区域的肿瘤抑制基因的签名,但许多像脆弱的网站。

“当显然在1990年代小说肿瘤抑制基因可能发现通过观察基因组缺失,许多手泵,”安迪Futreal博士解释说,癌症基因组项目的领头人之一。“但很明显,这并不是那么简单。新的肿瘤抑制基因就不容易找到,尽管许多缺失的存在。我们现在有一些了解的原因:许多地区的研究实际上是脆弱的网站。”

因为研究人员在癌症细胞系的基因不被删除,他们也发现了基因细胞生长所需,至少在人工环境实验室的试管。总的来说,在近750名癌症细胞系在这项研究中,使用九分之一基因被删除,因此细胞生存和生长的不是强制性的。

先前的研究表明,一个在X染色体上的100个基因可以灭活没有明显影响整个人的福祉,而类似的工作在整个基因组建议一个在50可以灭活基因在看似健康的人。因此,可以预见的是,癌症似乎比健康的人更宽容,会失去更大比例的基因不受损。

癌症研究,开发新颖的方法来辨别司机突变仍是一个至关重要的目标。

“这是一个步骤构建一套工具画出癌症遗传学的重要嫌疑人,“继续Stratton教授”工具,将使最巨大的努力,未来的国际癌症基因组协会等组织,将序列50多达500个样本的癌症类型在未来几年。

“我们的研究结果也说明小说发现摆脱基因组广泛研究,光线照在基因组生物学的其他角落。虽然我们不能夸大——这些都是癌细胞的增长在试管中——这是有趣地看到目录基本生存所需的基因不。”