南教授和学生培养金黄色葡萄球菌微阵列Meta-Database小姐

在正在进行的搜索一个疫苗对抗激进的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌,a南密西西比大学生物科学教授和学生开发了一个在线数据库,收集到的数据与金黄色葡萄球菌的基因。

的金黄色葡萄球菌微阵列meta-database这学期,称为SAMMD,推出了穆罕默德Elasri博士副教授的指导下。

“我们已经添加了这个生物信息学工具,特定的葡萄球菌感染,全世界,使研究人员能够看他们最喜欢的基因和它有关的所有信息,“Elasri说。

“这个数据库是独一无二的。其他数据库只告诉你关于论文发表在葡萄球菌,但你不能交叉引用其他出版物。SAMMD,你输入你喜欢的基因名称,这将能找到所有的信息从这些发表论文给你。”

金黄色葡萄球菌是一种重要的人类病原体,导致各种各样的疾病和感染。金黄色葡萄球菌菌株正在增加,每个都有自己的染色体是由约2500个基因组成的。

有些公司,如耐甲氧西林金黄色葡萄球菌,获得当前抗生素或突变基因免疫。

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌感染发生在每年估计有94000人,约19000人死亡,根据疾病控制和预防中心。

的搜索和研究基因与葡萄球菌比以往任何时候都必须找到一种疫苗,可以影响的新菌株金黄色葡萄球菌。

开发人员不断更新SAMMD包括最新的葡萄球菌数据。数据库有一个调节基因的约12236,这是不断增加。

“我们经常寻找论文葡萄球菌微阵列,“说Vijayaraj纳博士学生开发了SAMMD Elasri博士。微阵列是一种基因芯片技术用于标记基因研究。

“所有这些研究每个人都做的是发现目标基因变异,寻找其影响在其余的基因,”他说。

有超过500个SAMMD用户从29个州在美国每天和27个国家的数量还在不断增加。当研究人员努力发现耐甲氧西林金黄色葡萄球菌疫苗,Elasri说这个程序可以减少大量的时间找到葡萄球菌基因的信息。

“这是一个很好的研究工具,可以节省大量的时间,“Elasri说。“SAMMD允许研究人员做基因分析,以前不可能的。”