剪接变体揭示孤独症基因之间的联系
从加州大学一个研究小组,圣地亚哥医学院和癌症中心的系统生物学dana - farber癌症研究所(CCSB)发现了自闭症的一个新的方面,揭示蛋白质参与自闭症与更多的伙伴比先前所知。这些交互之前没有被发现,因为他们涉及或者拼接形式的自闭症基因在大脑中发现。
在他们的研究中,发表在2014年4月11日,在线的问题自然通讯科学家们孤立,数以百计的新变体的自闭症基因从人类的大脑,然后筛选与成千上万的其他蛋白质的蛋白质产品识别合作伙伴交互。alternatively-spliced自闭症基因产生的蛋白质和许多合作伙伴形成了生物网络,产生了前所未有的自闭症基因是如何连接的。
“当新发现的接头形式的自闭症基因被添加到网络中,交互的总数翻了一倍,”莉莉娅·Iakoucheva首席研究员说,博士,助理教授在加州大学圣地亚哥分校的精神病学。在某些情况下,拼接形式与一组完全不同的蛋白质。“从这个网络是我们所看到的,不同的变种相同的蛋白质可能会改变整个系统的布线,“Iakoucheva说。
“这是第一个proteome-scale交互网络将替代拼接的形式,”马克·维达尔指出,博士CCSB主管和研究员的研究。“事实上,蛋白质变异产生这些不同模式的交互是很让她兴奋和非常意外。”
新的网络也照出多个自闭症基因连接到另一个。科学家发现,一类突变参与自闭症,被称为拷贝数变异,包括基因彼此密切联系直接或间接通过一个共同的合作伙伴。“这说明共享生物学途径可能在不同的孤独症患者中断突变,”林co-first作者关宁说,博士,博士后Iakoucheva的实验室。
除了提供更大的广度和深度在自闭症蛋白质,未来自闭症研究网络代表了一个新的资源,根据Iakoucheva。例如,她说超过400的物理集合剪接变体自闭症的候选基因可以由其他研究人员感兴趣的研究一个特定的蛋白质变异。一些高度连接网络的合作伙伴也可能代表了潜在的药物靶点。所有交互数据驻留在自闭症研究的公开的国家数据库。
”组装自闭症网络,我们可以开始调查新发现的突变是如何从病人可能破坏这个网络,“Iakoucheva说。“这是一个重要的任务,因为突变蛋白的机理导致自闭症在99.9%的情况下仍是未知的。”
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出版
拱形门Corominas,新平杨官林Ning,胡舒立Kang Yun沈,莱拉Ghamsari,马丁兄弟,玛丽亚·罗德里格斯,斯坦利Tam,雪莱a区格,张裕干红,歌曲,缪拉Tasan厄玛Lemmens, Xingyan旷,南赵,雅各布·j . Michaelson Dheeraj Malhotra弗拉基米尔•Vacic Michael a . Calderwood弗雷德里克·罗斯Jan Tavernier史蒂夫•霍Kourosh Salehi-Ashtiani,乔纳森•Sebat德米特里•Korkin大卫·e·希尔通,莉莉娅·m·Iakoucheva马克•维达尔。蛋白质相互作用网络或者拼接亚型的大脑链接孤独症的遗传风险因素。自然通讯,2014年4月11日发表。doi: 10.1038 / ncomms4650
