圣裘德科学家开发新Genomics-Based方法理解癌症子组的起源

科学家们一直认为癌症可能在显微镜下看起来一样,但是携带不同的突变,对治疗的反应不同,导致对病人截然不同的效果。

国际圣裘德儿童研究医院的科学家领导的研究小组已经开发出一种新方法,利用不同物种的基因信息理解生物学驱动的形成这些不同的癌症亚型。

这种方法是由一个叫室管膜瘤的肿瘤,研究影响儿童和成人的大脑和脊柱,但也可能转化为其他形式的癌症。研究首次表明,在不同地区少见的神经系统时出现的子类型的干细胞发现获得特定的突变。

研究还发现的第一个基因,称为EPHB2,证明引起室管膜瘤和创造了第一个准确的实验室模型,这种疾病。这项研究发表在今天提前在线出版的著名科学杂志《自然》和由理查德•Gilbertson医学博士博士,圣裘德的成员部门发育神经生物学和肿瘤。

“我们已经开发出的方法为世界各地的科学家提供了一个灵活的方式来测试假设不同癌症的子集时出现的特定的突变发生在特定的细胞类型,“Gilbertson说。“因为实验室模型由这种方法准确模型患者亚组,它们可以被用来开发和定制有效的新治疗这些病人。”

项目建立在早些时候在其中工作的实验室正常干细胞在癌症中的作用。身体依赖于干细胞,可以分而承担更多的专业功能,保持器官修复和操作顺利。这项研究包括在美国科学家从7个机构、加拿大和英国。

在这项研究中,研究人员收集了204膜瘤患者在美国、加拿大和欧洲进行最全面的室管膜瘤基因组分析。研究人员发现DNA损益不同的模式依赖于大脑的室管膜瘤的位置或脊柱疾病和发现了九个亚型。

分析还发现了超过200个基因潜在的重要的引发肿瘤或帮助癌症扩散。列表包括EPHB2基因调节干细胞分裂和最近与肠道肿瘤。在这项研究中,研究人员联系EPHB2一室管膜瘤亚型。

研究人员还跟踪不同的干细胞群体,引起少见。使用一个算法由斯坦利磅,博士,准会员在圣裘德生物统计学,研究人员将人类瘤的基因表达模式与基因表达干细胞来自不同地区的胚胎和成年小鼠的神经系统。的数学工具使第一次比较全球物种之间的基因表达模式。

运动与人类癌症的一个亚型与特定族群的老鼠神经系统或神经干细胞。肿瘤抑制基因的干细胞还缺乏Ink4a / Arf。当EPHB2的额外副本添加到这些神经干细胞和细胞植入小鼠前脑,一半的老鼠发达大脑肿瘤在200天内。

科学家继续显示肿瘤与人类瘤由几个不同的措施。相比之下,没有少见发达时的额外副本EPHB2插入其他亚种群的小鼠神经干细胞。

额外的测试发现,鼠标室管膜瘤模型匹配只是人类的一个亚型少见但没有其他形式的共同的人类大脑肿瘤。