标准病理测试表现在膀胱癌分子亚型

在试图开发一种相对简单,廉价的方式给医生和他们的膀胱癌患者更好地了解可能的结果和最佳治疗方案,科学家发现,设计复杂的新的子类型化技术为此提供最好的信息比长期病理测试。

他们看着几组数据对癌症患者标本肌肉浸润性膀胱癌,高档癌症与高死亡率相关。数据集包括一个用于确定新兴分子亚型,结果病人的信息。

他们一贯发现分子亚型的膀胱肿瘤,目前给患者,超过了标准测试脱胎病理学家将癌症列为低收入或高档并确定其入侵的程度进入膀胱壁,周围脂肪,淋巴结,血管和超越,他们在一份研究报告的封面泌尿学杂志。

“肌肉浸润性膀胱癌咄咄逼人,它通常预后很差,”博士说Vinata Lokeshwar,生物化学和分子生物学系的主席奥古斯塔大学乔治亚医学院的。“每个人都试图找出如何提高诊断、治疗和生存。”

“病人的肿瘤的基因分析绝对有价值,使您能够发现司机个人的生长和转移,帮助直接治疗,即使它有助于确定新的治疗目标,“Lokeshwar说,该研究的通讯作者,格鲁吉亚癌症中心的一员。”,但使用这些信息来亚型肿瘤似乎并不增加患者诊断或预后价值。”

,而研究人员表明,需要更多的研究在分子亚型是用来帮助引导病人护理。

进化的诊断方法包括编译数据库对基因表达和突变在癌症类型找到的基因表达模式用于亚型的肿瘤病理上看起来相似,但分子不同。分子亚型的想法是能更好地显示,癌症是或多或少的侵略性和帮助引导治疗方案化疗前病变切除手术膀胱是否更好。

RNA序列,或RNA-Seq,联邦数据库的遗传物质从一个广泛的癌症,让调查人员来自世界各地研究基因表达在一个特定的肿瘤类型,寻找常见的一些基因的表达与一个特定的临床结果。腔的两个亚型,预测更好的生存,和基底,预测预后不良,对肌肉的浸润性膀胱癌首次发现,共有六个亚型已经出现了。第一篇论文在肌肉浸润性膀胱癌的亚型发表在杂志上自然在2014年。

但在他们寻找一个更简单,更便宜,普遍的检测方法提供类似的洞察力,调查人员发现,这些新兴亚型被通常的表现像肿瘤临床参数的等级及其扩散到淋巴结或血管,Lokeshwar说。

他们的工作正式开始与一个详尽的回顾研究生戴利莫雷拉和Sarrah s Lahorewala病人和不同数据集的分类方法用于识别分子亚型。

他们发现11个基因在所有亚型分类方法是很常见的。他们认为,如果他们要开发一个普遍的检测方法,基于这些共同的基因子类型化可能足够了。他们决定把他们新的子类型化面板,MCG-1。

而不是做RNA-Seq,花费几千美元,他们使用现成的逆转录定量PCR方法花费不到10美元,也看着基因表达,实际上是用于验证RNA-Seq数据,Lokeshwar说。

他们第一次看到自己的群52膀胱癌患者,39人肌肉疾病入侵。他们发现MCG-1只有31 - 36%准确预测重要的指标,如转移的可能性;疾病的特定的生存,这意味着幸存的膀胱癌;或整体生存,生存意义的各种原因死亡的癌症诊断或治疗开始的时间,直到研究结束。

认识到他们使用的数据集是相对较小的,他们没有使用RNA-Seq进行分析,然后使用三个病人数据集从癌症数据库ONCOMINE这有更多的患者- 151肌肉浸润性膀胱癌,还利用RNA-Seq看基因表达。

“我们发现同样的事情:MCG-1无法预测针对疾病的死亡率,”Lokeshwar说。在这个数据集,有些病人对化疗的反应信息,如常用cisplatin-based化疗后手术切除的膀胱,也可以但是亚型不能预测化疗反应,她说。

接下来他们观察的数据集使用的大型网络的调查人员确定亚型,TCGA癌症基因组图谱,或。TCGA的项目国家癌症研究所和国家人类基因组研究所从2006年开始,和收集了33个不同癌症的遗传物质。数据集包括常规病理信息402肌肉浸润性膀胱癌患者的标本。它还包括这些患者的总生存期和recurrence-free生存——如果癌症返回或进展。

“直到这一点上,我们看着病人,其他组没有看着,“Lahorewala说。

在这个数据集MCG-1预测总体存活率相似的发现报告亚型在几个高调的出版物。

“我们感到好奇为什么MCG-1不能预测任何我们的队列或ONCOMINE数据集,但预测总体存活率TCGA的数据集,”莫累拉说。

所以他们再看一眼402患者标本的数据集,发现21个病人的肿瘤实际上是低级的。低级的肿瘤患者有更高的生存能力和更好的比高档肌肉侵入性疾病患者预后。

当TCGA的低级病例数据集,MCG-1准确预测本质上没什么,甚至总体存活率。然后他们包括一些低级的肿瘤患者在自己的数据集,他们看着最初,和MCG-1现在能够预测转移和疾病的具体生存,研究人员说。

所有现有的子类型分为坏或更好的癌症预后的基础上,研究人员说。低级的存在肿瘤亚型的分类数据倾斜使它看起来像亚型预测总体存活率当真正预测癌症本身的品位。

”调查我们做的第一件事是问题我们的研究结果,因为结果是如此不同的比他人报道,“Lokeshwar说。

MCG的帮助下生物统计学家和Santu Ghosh博士合著者,他们也回去看着TCGA相同的病人数据集,他们分配了三个不同的亚型分类方法建立了膀胱癌症研究人员组成的一个网络。

“即使这些分类方法,建立亚型在预测准确率只有50%患者的总体生存率。再一次,常规病理参数如入侵淋巴结或血管比建立更准确的亚型在预测患者的预后,”Lahorewala说。

瑞典隆德大学最近的一项研究,调查人员发表在《华尔街日报》泌尿道的肿瘤支持MCG调查人员的调查结果。他们研究的519名患者膀胱切除因为患膀胱癌的发现亚型特异的生存。

问题的一部分与子类型化可能的内在异质性肿瘤,莫雷拉表示。有巨大的异质性肿瘤的基因表达,即使在相同的肿瘤类型,如膀胱癌、在同一肿瘤的不同部分。此外,这种模式的异质性可以改变在肿瘤的生长和治疗。

“只是因为它是膀胱癌并不意味着它是相同的所有病人。我们知道肿瘤非常动态存在异质性,”Lokeshwar说。

“因为有异质性,可能有问题当你想分类肿瘤到一个亚型,“莫累拉说。

顾名思义,肌肉浸润性膀胱癌症已经扩散的衬里sac-like器官肌肉墙。高档肿瘤,如果不及早发现,会蔓延到膀胱肌肉,而低级的肿瘤很少入侵。无痛性血尿膀胱癌是最常见的迹象,尽管只有很小比例的人得了癌症。吸烟是膀胱癌的主要危险因素。

参考:莫累拉,d S。Hasanali, s . L。Belew D。Ghosh年代。克拉森,Z。、约旦、a。R。,…Lokeshwar v . b . (2020)。比分子亚型的临床参数预测结果在膀胱癌:结果来自多个群组,TCGA包括。泌尿学杂志203 (1),62 - 72。https://doi.org/10.1097/ju.0000000000000351

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