测量的遗传景观乳腺癌和结肠癌

癌细胞的DNA的一个广泛的研究发现了大量的基因可能导致乳腺癌和结肠直肠癌的开发和发展。研究表明,每一个乳腺癌和结肠癌肿瘤是独一无二的,可以通过突变出现在许多不同的基因组合。

尽管有着固有的复杂性疾病,大约有280的新研究表明,大多数候选癌基因被研究人员参与数量小得多的生化途径——只有15岁。这些通路的研究已经产生新的诊断和治疗癌症的方法。

“我们需要开始思考癌症而言,这些途径而不是单个基因,因为这是一个更准确的对癌症产生。

大多数或所有的主要途径,至少导致这两种癌症被发现,“Bert Vogelstein说霍华德·休斯医学研究所的研究员Kimmel癌症中心约翰霍普金斯,他领导了这一研究。“我们需要开始思考癌症而言,这些途径而不是单个基因,因为这是一个更准确的对癌症产生。”

霍华德·休斯医学研究所的研究员桑福德·d·马科维茨凯斯西储大学医学院的42作者之一也在10月11日发表的文章,2007年科学表达。

团队孤立11乳腺癌和11结直肠肿瘤的DNA。然后比较了DNA序列的所有RefSeq基因在这些细胞基因序列来自人类基因组计划编制的参考序列。RefSeq纲要的18191个基因,代表该领域的标准,估计包含超过90%的人类基因组中的编码信息。

超过百分之九(1718 18191)的基因测序肿瘤中至少有一个DNA改变乳房或结直肠癌,改变了蛋白质编码的基因。但大多数这些DNA的变化是研究人员所说的“乘客”突变,没有参与肿瘤的发展。团队因此应用统计和生物信息学技术优先的突变,强调基因参与肿瘤发生最有可能的原因(“司机”突变)。通过这种方式,他们发现了280个候选癌基因最有可能司机和排名的基础上各种标准。

当团队制定了所有18000个人类基因在二维网格,形成候选癌基因的突变频率数据几在大量的“山。“山代表基因突变在一个大比例的乳腺癌和结直肠肿瘤,通常超过20%,而山突变在不到百分之五的肿瘤。平均15个候选癌基因突变在每个肠癌和乳腺癌,分别。

“关键信息,有一些山和许多山,低频变异统治这片土地,”劳拉说木头,一个医学博士/博士。在约翰霍普金斯大学的第一作者是谁。“真的不是预期几年前当我们开始这个项目。我们都希望找到更多山脉隐藏,和我们没有。”

一旦研究小组确定了驱动突变,它应用几种不同的技术来识别基因的特殊利益团体。例如,研究人员测试了他们发现将改变的预测结构突变基因所产生的蛋白质,对蛋白质的功能产生影响。他们还发现候选人癌症基因产生的蛋白质参与其他癌症基因的调控。“通过这样做,可以建立关系,链接山上,”福格斯坦说。“这是要开始把拼图的碎片在一起。”

大量的候选癌基因揭示了潜在的癌症的复杂性。“每个肿瘤基因不同于其他肿瘤一样,”伍德说。“这是一个令人生畏的观察对于我们这些试图找出如何诊断和治疗癌症。”

然而,研究人员正在兴奋底层的“逻辑”他们的研究发现了。“这是绝望的复杂吗?”Vogelstein问道。“我不认为,因为有一些关键的简化概念。”

“我们的数据表明,在乳腺癌的子集,这个途径,这些药物可能值得一试,”福格斯坦说。

特定的突变每个肿瘤的识别也可以给医生攻击或监测疾病的新方法。

更广泛地说,发现每个癌症是唯一的可以给医生一个裁缝癌症治疗个人的机会。“绝大多数的微妙的突变个体病人的肿瘤现在可以确定与现有的技术,使个人癌症基因组学成为现实,”研究者总结科学快讯。