柳枝稷植物的基因影响微生物的组成

植物提供一个家,一个广泛的多样性微生物,尤其是在根部。反过来,这些社区可以提供主机的bet188真人重要利益。这项研究调查了寄主植物的基因如何决定细菌群落的组成与植物的根。bet188真人

研究确定一组核心的菌株,在柳枝稷的根源。许多这些细菌丰度在不同植物的基因型。研究然后绘制基因在宿主基因组中,似乎影响这些微生物的丰富。这种映射显示基因在宿主免疫力,植物开发和激素信号在植物如何获得他们的微生物组的角色。

的影响

植物依靠他们微生物组来执行至关重要的功能。研究者试图繁殖植物品种,增加有益对细菌。然而,科学家们已经有限的知识程度宿主基因影响微生物的组成。本研究发现主机柳枝稷植物的基因型影响的很大一部分植物的微生物。这项研究还确定了柳枝稷基因似乎影响这些微生物的丰富。这些结果可以帮助工程师或繁殖植物品种,形成更强的有益微生物协会。

相伴的植物微生物群可以大大有助于植物生长和产量。宿主遗传变异如何影响root-microbiome大会是一个开放的问题。花园在这项研究中,研究人员使用一个共同的方法与现场站点在德克萨斯州,密苏里州和密歇根州发现柳枝稷根微生物的组成,描述环境的影响与宿主基因组成的根微生物组,确定假定的位点在宿主基因组中涉及微分微生物组成。团队包括来自德克萨斯大学奥斯汀分校的科学家,HudsonAlpha生物技术研究所,在劳伦斯伯克利国家实验室联合基因组研究所,密苏里大学和密歇根州立大学。

通过测序的努力联合基因组研究所的研究人员发现,柳枝稷根微生物群组成主要是网站的依赖。然而,有一组守恒的核心中细菌丰度高跨站点的根。大多数这些核心微生物不同宿主基因型之间的丰富环境相关的方式。最后,研究人员使用一个全基因组关联研究(GWAS)框架识别位点在宿主基因组中与这些微生物的不同丰度有关。

基因的变化与植物免疫力,发展,信号与微生物有关成分差异。这些结果提供了一个深入了解植物利用的机制来修改他们的微生物群,给一个大道调整其微生物繁殖的宿主植物。

参考:爱德华J,萨兰B, Bonnette J,等。基因因素switchgrass-root-associated微生物群在网站生成自然范围。现代生物学。2023年。doi:10.1016 / j.cub.2023.03.078

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