武田选择Genedata基因组分析表现主义
Genedata已经宣布,武田制药公司扩大合作Genedata许可Genedata表现主义的基因组分析®。武田将使用解决方案管理、分析和可视化大量原始数据从下一代测序(门店),微阵列,真正的time-PCR,和其他基因技术。作为企业级,高通量系统,可以同时分析成千上万的实验,Genedata表现主义的基因组分析整合基因组学、转录组、表观遗传和表型数据。让武田跟踪数据和结果,同时促进标准化和再现性实验中,Genedata表现主义的基因组分析有助于武田推进生物标志物的发现项目。
“多年来,武田依赖Genedata表现主义为我们的生物标志物的发现,质谱,我们享受了与Genedata长期和协作关系,“武田科学家指出负责生物信息学研究。“我们寻找解决分析门店数据,可以结合我们其他mass-spectrometry-based组学活动。Genedata表现主义及其功能基因组分析独特的处理高通量数据的可视化交互式基因组——本质上是一个高度直观的基因组浏览器——将证明特别有用到我们的门店分析。”
如武田制药公司正在使用Genedata表现主义为基因组分析的应用程序包括:个性化医学;生物标志物发现预测药物疗效和毒性;描述的细胞系,异种移植和其他模型系统;基于基因组和转录组分析和分子诊断。
大数据,容易处理
建立在开放和灵活的客户机-服务器架构,Genedata表现主义的基因组分析在大型和复杂的实验数据集来自所有主要供应商和技术平台。它有助于生物学之间的桥梁和统计,使先进的统计工具,可以分析最复杂的生命科学数据,可以广泛的用户。这些统计工具发展的理解生物系统和疾病支持一些以下技术:
•基因组学/ DNA-Seq:量化SNPs和InDels;染色体重排基因融合;称为变体的质量控制;注释的变体dbSNP或其他外部来源;变异的功能注释;和拷贝数变化的分析。
•转录组/ RNA-Seq:基因、外显子和转录水平量化和表达分析;成绩单、小说的识别基因和外显子;微分表达式分析;rna编辑和检测。
•表观基因组学/ ChIP-Seq Methyl-Seq:峰值检测;检测峰地区的注释;量化的DNA甲基化芯片或重亚硫酸盐处理DNA实验;和识别和注释差异甲基化的网站。
“武田是一家全球制药公司与我们扩大我们的成功感到骄傲和长期的关系,”奥斯马博士说Pfannes, Genedata的首席执行官。“这种合作验证我们的战略位置Genedata表现主义作为集成平台不同的组学技术。Genedata支持门店项目是一个主要的焦点,我们致力于与武田等创新型企业开拓门店提高医疗。”