靶向下一代测序可以帮助诊断原发性免疫缺陷疾病

原发性免疫缺陷疾病(PID)可导致慢性和有时危及生命的感染。目前已有超过450例pid病例，但及时准确的诊断仍然是一个挑战。在一个新的研究在分子诊断学杂志，研究人员使用下一代测序技术测试了来自22名研究参与者的130种不同免疫系统基因的DNA小组。他们发现，许多患者遗传了一种导致免疫系统紊乱的基因缺陷。这些发现将有助于对可能遗传了相同基因异常的家庭成员进行更好的治疗选择和早期诊断。

“基因检测的成本很高，而且主要针对单个或极少数基因的DNA测序。因此，基因诊断对许多患有pid的患者是有限的，”首席研究员Lloyd J. D 'Orsogna解释道，MBBS，博士，西澳大学医学院;西澳大利亚珀斯菲奥娜·斯坦利医院PathWest实验室医学临床免疫科。

“基因技术的最新进展使我们能够负担得起对同一个人的多个基因进行检测。因此，我们可以确定一种可能导致患者频繁感染的特定基因。更早、更准确的诊断可能会改善患者的预后，并预防并发症，”D 'Orsogna博士说。

这项研究招募了22名无关的普通可变免疫缺陷(CVID)患者，这是一种常见的PID类型，以前未知的遗传诊断。DNA样本用包含120种不同免疫基因的下一代测序板进行了测试和处理。有130个基因变异被鉴定出来进行分析。通过文献回顾、功能测定和家族研究评估了以前与CVID无关的新变异的致病性。

研究人员在22例患者中确定了6例(27%)可能的致病变异。在另外4例患者中，发现了意义不明的变异(VOUS)。VOUS是一种遗传变异，其临床意义在现阶段尚不清楚，但可能导致该病。总的来说，研究人员能够在近一半的患者中识别出遗传异常。所有检测到的变异均经常规Sanger测序确认。

在这项研究的显著发现中，有一名患者的脑脊液出现了新的变异AICDA以前没有报道过的基因。她的儿子也被确诊为CVID，也遗传了同样的突变。另一位患者有一种新的致病性变异国际安全和发展理事会基因，与免疫缺陷和免疫反应有关。在另一名CVID患者中，也检测到一种基因变异BAFF-R基因，增强B细胞存活;但经流式细胞术分析证实为致病性。

这样的基因诊断可以为患者提供有针对性的治疗方案。他们还可以为确诊CVID患者的家庭成员提供早期干预。例如，小说病人的儿子AICDA变种人在组建家庭前接受了遗传咨询。

“我希望基因医学的新时代能够更早、更准确地诊断，可能会为所有人带来更好的治疗和结果，”D 'Orsogna博士说。

参考:王晓明，张晓明，张晓明，等。一种用于诊断常发性免疫缺陷的新型靶向扩增子下一代测序基因面板具有较高的诊断率:来自珀斯CVID队列研究的结果。J Mol Diag．2022.doi:10.1016 / j.jmoldx.2022.02.007

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