技术拓展了对葡萄灰比诺病毒的认识
以法国南部教皇新堡地区的一个特定葡萄园为重点，植物病理学家花了8年时间监测了60多株葡萄灰比诺病毒(GPGV)的迹象。与之前在意大利的观察结果相反，他们观察到病毒的爆炸性繁殖，在2014年至2015年期间，超过75%的测试植物被感染。令人惊讶的是，在研究的剩余五年里，只有少量的葡萄被检测出阳性。
GPGV于2011年在意大利东北部首次被发现，这要归功于高通量测序(HTS)，这是一种更新的技术，它增强了我们更好地了解植物反应和基因组表达的能力。植物病理学家还可以使用HTS来识别病毒组，它描述了样本中病毒基因组的组合。
在研究GPGV时，植物病理学家Jean-Michel Hily和同事从18个样本中恢复了基因组信息，并重新组装了25个完整的基因组。
Hily解释说:“结合系统发育分析，我们提出了GPGV在教皇新堡地区引入和传播事件的系统动力学重建模型。”“在CDP葡萄园中引入GPGV的最高概率估计是在1999年到2003年之间，有3到6个可能的独立引入。同样重要的是要指出生物信息学工具已经变得多么强大——我们的模型准确地预测了2014年至2015年间葡萄园内的传播浪潮，这已经被RT-PCR证实了。”
他们的发现与两个意大利葡萄园的GPGV情况形成对比，后者描述了随着时间的推移，病毒快速但有规律地逐步传播。该病毒在法国葡萄园的爆炸性增加了我们对GPGV的理解，并提出了关于病媒、特定气候条件或其他未知参数的问题。
Hily和同事以前写过GPGV的文章。他们的第一项工作提供了该病毒的全球进化史研究，并对他们的最新工作进行了很好的补充，后者提供了当地范围内流行病学的更多细节。
“我们的研究结果还强调了病毒的引入(很可能来自受感染的材料)与其通过载体在植物间传播之间的脱钩。”了解更多关于他们的发现，请阅读植物生物群落杂志上的“葡萄葡萄灰比诺病毒在葡萄园爆发的生物学证据和分子建模”。
参考
李志强，李志强，李志强，等。葡萄葡萄灰比诺病毒在葡萄园暴发的生物学证据和分子模型。Phytobiomes杂志．2021; 5(4): 464 - 472。doi:10.1094 / pbiomes - 11 - 20 - 0079 - r
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