TGAC获得£150 k,帮助促进科学创新

英国有一个最强的全球科学社区继续占世界上16%的最常被引用的科学出版物,然而,创新已经下降在过bet188真人去的五年。加速概念到商业化转化资金至关重要,弥合基础科学和应用之间的差距。

这些赠款将允许科学家在诺维奇研究公园利用自己的知识资产,导致成功的商业和社会影响在本地和全国范围内。增长的潜力不仅知识,而且新技术,产品和企业,它可以帮助维持英国生产力和经济繁荣。

外观:视觉探索基因组数据的开源库

TGAC,与Repositive合作。io,开发一个开放源码工具集视觉探索基因组学临床研究数据。

没有新工具,大大提高效率的基因组学应用信息学相关的年度成本分析和解释的生物数据将从2012年的35%的成本显著增加55%的成本在2020.1

随着生物技术市场预计从2012年到2018年每年增长22.7%,达到580美元million2,越来越商业信息工具,方便访问需要大型基因组数据集的分析研究和临床使用。

世界各国政府正在DNA测序的一部分主流医疗通过推出大量测序项目。并行、研究和医药组织生成大量的数据和合作管理和深远的研究分析。

高的生产数据之间的差距及其在基因组研究解释需要高效的可视化工具允许临床医生和研究人员识别疾病的遗传原因和特征。

正面,一个开源的web界面耦合的想象从Repositive基因组数据。io平台,将直接解决这一日益增长的商业需求的研究社区基因组学通过启用视觉探索解决方案,支持那些缺乏利用大量的数据资源。1工具的设计将允许容易与其他数据源的配置的公共或私有数据。

促进用户驱动的查询表明基因标记来帮助诊断遗传疾病、生物信息学软件将使临床医生和研究人员探索基因组数据视觉和互动的方式,无需编写复杂的查询或编程代码。

Manuel Corpas TGAC项目领导和项目负责人说:“我们希望外观产生重大影响的临床医生和研究人员与异构和分布式交互基因组来源的数据在一个直观的方式”。

多功能数据集成软件工具来提高元数据和网络分析效率

TGAC,与英国食品研究所合作(IFR),开发一种新型的软件,提供了一个全面的系统生物学平台为一体的多元化的数据集。定制Omix导航器将可以从2016年春季。

在生物科学,数以千计的新的生物数据集和资源每年发表。评价和综合使用这些系统的资源是困难的尽可能多的数据存储在不同的格式。现在大约70%的数据驱动的项目涉及管理数据集成、转换和清洗之前实际的分析开始。

集成不同的数据类型,如疾病、基因组、蛋白质组或转录组数据集是一个非常耗费时间和资源。Omics-specific工具,像星系,榆树,Expasy是有效的在关注一个数据类型,但不能帮助用户在必要的工作,多尺度水平,结合不同的组学数据集。

对于元数据分析,有必要提供工具,使一个一体化的生物系统。OmiX导航器,是基于云的web服务,包括先进的可视化、多层数据库、数据集成和评估解决方案,以及网络分析工具和工作流管理平台。

计算生物学研究员项目领导Tamas Korcsmaros基因组分析中心(TGAC)和研究领袖IFR,说:“研究人员用湿实验室背景有不同的生物学问题,但在大多数情况下,帮助调查科学问题的计算方法和指导实验非常相似。

“然而,可用的软件解决方案不允许复杂的生物学问题的简单分析,宿主-病原体相互作用,如不同牲畜之间的系统性变化特征和炎性疾病在人类全基因组分析。

与Omix导航器”,我们将提供一个易于使用,插头和播放软件等同事促进系统生物学相关项目。我很兴奋在这个项目工作的优秀的计算生物学家同事TGAC和湿实验室的研究人员在诺维奇仪表开发Omix导航研究园。”

OmiX导航器原型将根据其目标市场包括科研机构、合同研究组织(cro)需和生物技术领域的中小企业;从2016年3月。

新工具显示候选分子加速药物发现

TGAC,与IFR合作,旨在开发一个生物信息学软件,将预测活性化合物药物个性化医学进步。

NaLeSST(自然铅结构建议工具)将会是一个有价值的工具在加速药物发现过程中,与潜在的商业应用个人化药物对抗的时代复杂的疾病和耐药细菌。

虽然使用多个计算生物学方法在合理药物设计,当前工具存在许多挑战,如化学库包含分子从天然产物结构也不同;低效的图书馆搜索;大量的手工工作在药物开发管道;随后和意想不到的毒性和药物不良反应。

随着它的发展,该项目将受益于将现有的知识和数据通过高通量基因组技术,包括整个诺维奇的证据中获得健康相关项目研究公园。

Co-Project领导有意Jurkowski组长TGAC整合基因组学的,说:“NaLeSST的想法是由于我们的经验在cheminformatics分子建模和共同利益解开天然化合物的潜力。

“发现的新路线的迫切需要。目前,还没有专门的资源,以促进途径达到药物靶点主要发展重点自然化合物。

“我们相信这样的资源将成为企业选择工具处理早期药物研究和开发,特别是,寻找新的途径来识别活跃的线索。对于任何目标分子,NaLeSST可以自动显示潜在的领导结构作为相应的药物开发的起点,缩短主导的成本由专家研究。

“我们观察到在过去的十年里,减少新化学实体被引入市场。我们相信,我们的研究能有助于恢复这一趋势。”

TGAC由BBSRC和经营战略是国家能力促进基因组学和生物信息学的应用生物科学研究和创新。