癌症基因组图谱为技术开发奖资金

作为癌症基因组图谱的一部分(TCGA)试点项目,美国国立卫生研究院的(NIH)授予八两年总价值为340万美元的赠款,支持创新技术的发展为探索癌症的基因基础。

的国家癌症研究所(NCI)和国家人类基因组研究所(NHGRI),国立卫生研究院的一部分,2005年12月宣布TCGA计划测试大规模的可行性,系统方法识别的变化发生在肿瘤细胞的基因组。

目标是生成基因信息,研究团体可以使用它来开发新的和改进的策略检测,治疗,最终,预防癌症。

正在研究飞行员的肿瘤类型包括脑癌(胶质母细胞瘤)、卵巢癌和肺癌(鳞状细胞),占200000多例癌症每年在美国。

“除了详细的基因组数据生成,TCGA有真希望将促进技术发展和降低其成本,“NCI主任约翰·e·Niederhuber说,医学博士

“我们最大的挑战将是在应用TCGA卷的信息将提供关于肿瘤癌症基因组数据收集从大型群病人,为了更好地预测,甚至阻止,最早发展的癌症,”他继续说。“癌症构成非常复杂的挑战。每一个许多类型的癌症可能会有不同的基因组配置文件或配置文件集。

机构和主要研究人员选择接收两年期赠款是:

•贝勒大学医学院休斯敦;Milosavljevic亚历山大博士;413000美元;“综合癌症基因组高通量的映射”。这个项目将开发方法,利用高度并行DNA测序平台调查癌症细胞的基因组结构的变化。

•城市的希望/贝克曼研究所杜阿尔特,加州;Gerd Pfeifer博士;465000美元;“癌症基因组DNA甲基化”。这些研究人员将工作方法分析跨基因组DNA的甲基化在高分辨率使用1000癌细胞。

甲基化,包括添加甲基DNA分子的支柱,可以改变的基因与基因的转录机械。

•哥伦比亚大学,纽约;本杰明Tycko,医学博士博士;443000美元;“基因组和MSNP外遗传性分析”。这个团队将专注于使用高密度寡核苷酸阵列特征基因畸变和DNA甲基化。寡核苷酸单链DNA或RNA的短序列通常用作检测探针互补DNA或RNA因为他们绑定随时补充。

•哥伦比亚大学,纽约;蒂莫西•贝斯特博士;362000美元;“高通量基因组甲基化模式的分析”。这些研究人员将开发高通量方法,高分辨率的DNA甲基化分析。

•约翰霍普金斯大学巴尔的摩;安德鲁•范伯格医学博士,每小时;464000美元;“功能等位型”。这组将生成新方法为研究allele-specific基因表达模式。

研究人员使用等位基因一词来指一个基因的变体形式。

•罗氏系统公司。威斯康辛麦迪逊分校。托马斯•艾伯特博士;415000美元,“大规模基因位点的选择”。这个团队将使用高密度寡核苷酸阵列以一种创新的方式来选择基因组区域的DNA序列分析。

•斯坦福大学、斯坦福、加州;罗纳德·戴维斯博士;429000美元;选择器对癌症突变分析的“发展”。这个项目将开发高通量基因组区域的隔离方法DNA序列分析。

•大学的回应;佩吉·萨利博士;418000美元;“扩展Chip-Chip试验改进分析临床Biospecimens”。这些研究人员将工作方法,可用于高通量查案的癌症相关基因的变化区域重要的基因调控,使用小片段的癌组织。

技术开发工作将会影响的其他关键部件TCGA计划项目:三个基因组测序中心,七个癌症基因组鉴定中心、数据协调中心和Biospecimen核心资源。

试点项目将建立一个公开的综合数据库,个别研究人员可以用它来研究特定癌症的基因组变化开发新目标新一代的药物和诊断。

TCGA数据将通过公共数据库支持的NCI癌症生物医学信息学网格™(caBIG™)和国家医学图书馆的国家生物技术信息中心(NCBI)。TCGA数据将提供的方式保护和尊重都达到了最高标准的研究参与者。