三个癌症基因组鉴定中心选择概要文件癌症安捷伦的微阵列平台
的国家癌症研究所(NCI)宣布授予接受者梦寐以求的癌症基因组图谱试点项目,包括三个机构使用微阵列平台安捷伦科技有限公司:北卡罗莱纳大学,丹娜-法伯癌症研究所和纪念斯隆-凯特琳癌症中心。
这些机构中有七个是在三年内获得总计3500万美元的NCI资助癌症基因组鉴定中心(CGCC)是为了实现Atlas项目。
这三个机构将依靠安捷伦的基因组学的解决方案,包括微阵列、试剂、硬件和数据分析工具。
作为NCI倡议的一部分,每个CGCC预计过程至少每年1000份临床样本。
CGCC倡议强调高通量、高分辨率技术综合检测基因组外遗传性和转录组畸变,包括改变DNA片段的拷贝数,易位,杂合性丢失,改变DNA甲基化模式和基因表达的变化,所有这些都可能在癌症中发挥作用。
试点项目将探索的好处的系统方法分析特定类型和子类型的肿瘤。
“北卡罗莱纳大学的集团,总部位于Lineberger综合癌症中心,将执行全基因组基因表达分析和微rna表达分析,使用安捷伦DNA微点阵益生元,“北卡罗来纳大学教堂山分校的查尔斯·m·Perou解释说,博士,副教授,遗传学。
“UNC集团选择了安捷伦平台由于其基因内容的灵活性,它允许研究人员改变任何功能,或基因,在任何时候。”
“新基因、小分子核糖核酸或基因拼接形式被发现,他们可以很容易地和无缝地列入下一阶段的微阵列。”
“安捷伦平台为每个特性提供了经过验证的敏感性和特异性,”他补充道。
“精简协议和硬件,将使我们能够实现癌症基因组图谱项目要求高吞吐量的需求。”
小说”这个中心的目标是识别基因在癌症的发生和发展的重要量化中使用arrayCGH DNA和RNA的剂量,或比较基因组杂交,和一本小说,高度敏感的方法叫做香肠测序,“说的下巴。
“我们选择CGH作为一个关键工具,因为基因组的改变已被证明是一种高效的入口点的发现癌症相关基因,”她补充道。
“我们选择了安捷伦平台由于其良好的信噪比时检测与全面复杂性基因组DNA杂交。”
“我们完全相信,未来的研究人员将建立在这项工作,使用相同的全息平台。”
“可喜的是,安捷伦芯片扮演如此重要的角色在这个至关重要的项目,”安捷伦基因组学营销总监凯文Meldrum说。
“微阵列的效用已超出应用,如全息基因表达,DNA甲基化,和microrna的。”
“我们使这些研究以及开发我们的微阵列技术通过优化之间的平衡密度、敏感性和灵活性与我们的平台。”
“这是有益的,知道这些主要研究者和NCI欣赏这种方法的价值。”
