TTP Labtech,加州大学圣地亚哥分校合作
TTP Labtech有限公司和加州大学圣地亚哥分校(加州大学圣地亚哥分校)已经宣布他们的合作导致了一个新的工作流为单细胞测序,这降低了样品制备的成本90%。工作流,已发表在《实验室自动化,开发通过结合加州大学圣地亚哥分校的专业知识在基因组学和TTP Labtech蚊子液体处理程序,可吸管nanolitre微升卷具有准确性高、重现性好,使小型化和自动化这个过程。
尽管单细胞基因组学发展迅速,研究人员面临挑战与再现性,敏感性,可扩展性和成本,特别是当试图使小型化高吞吐量的应用程序。最大化准确度和精密度、图书馆准备协议推荐量的范围内手动吸量管或大容量液体处理程序。但是,只有一小部分的每个图书馆准备将测序所需。加州大学圣地亚哥分校的焦点的与TTP Labtech合作是使小型化单细胞RNA图书馆准备反应装置,减少样品和试剂的需求。
由此产生的工作流已被证明会降低图书馆准备成本高达90%,同时保持吞吐量,准确性和重现性。图书馆准备卷的小型化是通过使用TTP Labtech蚊子高温超导和高压液体处理程序,它准确地分配卷25µL nL和1.2和0.5之间5µL,分别。仪器使用真正的正排量移液技术,保持体积精度甚至对高粘性液体,使高浓度gDNA处理,节省试剂和样本输入成本。
评估质量的库,加州大学圣地亚哥分校应用工作流分析胰腺人类胚胎干细胞的分化。由此产生的单细胞RNA-sequencing数据进行分析,以确定该系统的再现性和能力之间的区别不仅细胞在分化的不同阶段,但单个细胞之间也在每一个阶段。
Joby詹金斯,公司产品经理,TTP Labtech,评论道:“单细胞测序需要处理大量的样本,以基于人口的研究提供有效的数据。再现性和敏感性,以及可扩展性和成本,可以限制因素大量的细胞进行分析时,我们很高兴,我们的伙伴关系与加州大学圣地亚哥分校取得我们的目标提高样本准备单细胞基因组学研究”。
路易斯·劳伦特博士,医学博士,博士,副教授,加州大学圣地亚哥分校,说:“我们的工作流开发,与TTP Labtech合作,有可能为研究人员提供节省成本,同时保持单细胞测序的质量。仪器成本和易用性使实验室的蚊子液体处理程序可行的选项,要缩小的新一代测序样品制备和自动化。“TTP Labtech将展示海报的发布工作流在单细胞基因组学会议上,2016年9月14 - 16,威康基因组校园Hinxton,英国和展示ASHG 2016展位# 1326,2016年10月在18到22岁,温哥华BC,加拿大。
