揭露人类癌症信号的地图

科学家从国家研究委员会,生物技术研究所在蒙特利尔(NRC-BRI)最近发布的地图人类癌症信号提供了一个框架,用于发现首选组合使用的信号级联癌细胞。

这项研究提供了一个更全面的图片关于蛋白质在细胞通讯驱动癌症发展。人类癌症信号映射包含大约300个蛋白质和近900信号各自的基因之间的关系,在癌细胞突变或甲基化。

研究人员发现10%的信号关系占大多数的信号交互最常用的多种肿瘤。这些可以被看作是信号通信高速公路对癌症发展和进展。

手动生成这样的地图,研究人员首先构造一个网络图的人类细胞信号封装细胞信号积累知识生产在过去的60年。

网络中的节点然后注释列表的基础上几百癌症会突变基因、肿瘤基因组大规模测序确认的。从这个出现人类癌症信号映射。

“巨大的努力已经在过去的几十年里说明癌症信号。然而,这是一个很难得到的线索组织癌症信号在结构上和功能上,”合著者Maureen O 'Connor-McCourt说工作和科学领袖NRC-BRI癌症基因组项目。

第一眼“这提供了更多的全球癌症信号的体系结构,它提供了一种肿瘤发生的蓝图。著名的癌症信号事件中可以看到许多新的癌症的地图以及建议信号事件,生成一个可测试的假设。”

基于这些蛋白质信号之间的关系,人类癌症信号映射可分为12个信号通信网络模块。

“传统上,科学家将细胞信号视为线性路径,喜欢城市的途径和道路。我们看到的信号映射为网络或“线路图”。信号通信网络模块就像一个面积等城市的市中心,它是一个地区的许多不同的途径和道路。在生物学,基因在一个模块将执行类似的生物功能,”埃德温·王解释说,该研究的通讯作者,NRC-BRI生物信息学的科学家,在分子生物学和计算机科学训练。

”虽然在肿瘤基因突变是非常复杂的,它们可以被分为几个信号模块,从而揭示癌症的潜在逻辑信号,”玛丽亚Jaramillo说NRC-BRI肿瘤细胞生物学家、该研究的作者之一。“这项工作的一个非常有趣的方面是不同肿瘤类型出现的演示通过不同的机制,实现肿瘤发生。通过不同的信号模块之间的合作。”

的过程中发现致癌的刺激是人类信号嵌入到网络的假定的监管机制揭示这些刺激。例如,激活突变是丰富积极的信号管理循环,而甲基化的基因和灭活突变的肿瘤抑制中丰富负面信号管理循环。

采用一套系统生物学方法,研究人员目前癌症的分子机制的网络视图暗示将塑造我们对基本的肿瘤细胞生物学的理解。这些知识可以帮助指导结合药物治疗的合理选择特定的肿瘤类型,在形成癌症的早期诊断的新策略。

一些研究人员批评肿瘤的全基因组测序的效用。他们认为它是耗时、耗资源和不清楚的结果。然而,这项工作是一个反例这样的观点。

“通过适当的生物信息学分析,重要的和有意义的生物的见解可以提取大规模癌症基因组测序的努力,“Enrico Purisima说,他是这项研究的合作者之一,在NRC-BRI计算生物物理学家。

这项工作将在线发表在12月18日,星期二分子系统生物学。团队的成员都来自加拿大国家研究委员会,中国的天津师范大学,天津大学。