揭露各种肾癌细胞签名

肾癌的七种类型的起源,包括一些罕见的亚型,发现了威康基金会桑格研究所的研究人员,大奥蒙德街医院(天哪),公主Maxima中心儿科肿瘤学和Oncode研究所。研究结果证实这些癌症细胞在特定形式的起源发展中成熟的胎儿。

这项研究发表在今天(6月23日)自然通讯使用计算方法来分析现有的数据集和确定不同癌症的细胞信号的出现。这种方法拥有承诺作为诊断工具罕见的癌症患者,在这项研究中,一个病人的神秘肾癌被认定为Wilms-like肿瘤通过观察其细胞信号。

所有癌症源于正常细胞已经开始不受控制地增殖。通过比较癌症和正常细胞的基因表达模式,可以了解每个肿瘤的起源和行为的各个方面。这种类型的分析已经成为可能,通过信使rna单细胞测序的出现,高分辨率的技术,可以识别不同的细胞存在于一个组织根据单个细胞的基因表达。

先前的研究已经使用这些技术比较正常和病变组织在一些最常见的肾脏肿瘤,但在许多数以百计的肿瘤进行单细胞测序将无法实现。

在这项研究中,威康基金会桑格研究所的研究人员和他们的合作者转向计算技术挖掘人类细胞阿特拉斯(HCA)参考数据*和数据库的肿瘤基因表达。他们在1300年评估信使rna信号童年和成人肾肿瘤,横跨七个不同肿瘤类型,以调查这些癌症的起源* *。

结果证实了这些儿童癌症的起源发展,发生在一个特定的错误后发育成熟细胞类型的旅程。相反,成人肾脏癌症从成熟细胞类型,不回复的发展模式在绝大多数情况下基因表达。

每个癌症类型还发现表现出独特的“细胞信号”,或基因表达模式,可以用来分类他们的未来。

马修年轻博士威康基金会桑格研究所的这项研究的第一作者,说:“长期以来人们一直认为,儿童期肿瘤“胎儿”的起源。现在我们可以代替松散定义精确,定量测定细胞的信号,不同的肿瘤类型展览。我们的分析还驳斥了这一理论,成人肿瘤回归发展状态,除非他们是成年人的高致命性亚型肾癌。”

这项研究揭示了行为和一些肾脏肿瘤亚型的罕见的起源是很难检查。这些都是先天性中胚层肾瘤,肾透明细胞肉瘤,恶性杆状的肾脏肿瘤,和chromophobe肾细胞癌。

发明的方法研究还有助于分类一个病人的肿瘤,临床医生无法诊断完全。

Karin Straathof博士是这项研究的资深作者从大奥蒙德街医院,说:“有时候,不可能完全诊断儿童肾癌通过常用的方法,它可以影响我们的能力采取最佳的治疗。一本研究中使用的样本是一个孩子用一个未确诊的肿瘤。但通过分析基因表达的肿瘤细胞,我们能够认识到这是霍奇金病的肿瘤。我希望这种方法可以用在这种情况下未来。”

在最近的研究中,研究人员已经确定了个人的童年癌症的起源,如神经母细胞瘤、使用信使rna单细胞测序在小数量的肿瘤。在这里,计算分析现有的数据被用来确定一个更大的团体的起源的童年癌症。

山姆Behjati博士威康基金会桑格研究所的这项研究的资深作者,说:“这不仅计算方法使用现有的数据集验证之前的结果童年肾癌的起源,它提供了一种新的方式来扩大这项研究更大数量的肿瘤和罕见的癌症类型。我相信,这种方法可以作为成功的蓝图调查行为和全方位的人类癌症的起源。”

参考:年轻的MD,米切尔TJ,卡斯特L, et al .单细胞派生的信使rna信号在人类肾脏肿瘤。Nat Commun。2021;12:3896。doi:10.1038 / s41467 - 021 - 23949 - 5

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