理解条件如何影响环境DNA分析
DNA分析可以检测水环境生物没有先捕获它们。第一次,一个团队在慕尼黑工业大学(TUM)系统地研究了各种环境因素对环境的影响DNA分析。通过这样做,研究人员做了一个重要一步的标准化应用这种方法对水体的监测。
动物DNA释放到水生环境中可以使用分子检测分析。这种检测方法被称为环境DNA(埃德娜)一个简单的水样为这个技术是充分的。然而,这种方法并不同样工作在所有水体,因此很有可能受到各自的条件在每个身体的水。这可能包括有机和无机成分的水或流动的条件。到目前为止,几乎没有强烈的个人因素如何影响研究分析过程。
Bernhard Stoeckle博士和塞巴斯蒂安Beggel,椅子的研究员水生系统生物学和分子生态的单位慕尼黑工业大学(动物学的椅子)调查了各种环境因素对埃德娜的影响分析的一个实验。实验的想法是基于先前的埃德娜研究原生贻贝的物种。
系统的实验结构
在系统实验室的设置中,鱼属于入侵物种——圆虾虎鱼(Neogobius melanostomus)——保存在水族馆在不同密度、不同流量条件下,有或没有泥沙,后被从水中定义一段时间。
随后,研究人员定期取水样的六天为了能够评估埃德娜的效率分析随着时间的推移。此外,研究人员还添加一些物质,这可能会阻碍分子分析如藻类、腐殖质物质,水和无机悬浮颗粒物,也在自然生态系统中找到。
“这是特别重要的,否则我们无法对埃德娜的研究发现,“Bernhard Stoeckle解释道。为了找出哪些因素影响最大,然后研究人员比较了艾德娜彼此所有水样品的结果。
程度的影响因素会随着时间而改变
一方面,实验的评估表明,在它的整个持续时间、流动条件下,沉积物的存在与否,和鱼的密度只有影响分析相互结合。另一方面,原来的程度的影响因素随着时间发生了很大变化。
抑制剂的添加、有机物质(腐殖质物质)干扰分析。他们经常完全杜绝方法的成功应用。只能检测到41%的DNA样本。藻类也有类似的效果,但不明显。“我们的研究结果清楚地证明是多么重要,环境条件也考虑在执行埃德娜分析为了能够正确解释研究结果,”伯纳德Stoeckle说。
根据实验的结果,可以得出结论,具体环境条件极大地干扰环境DNA实验,在某些情况下检测物种困难甚至不可能。
这篇文章被转载材料所提供的慕尼黑工业大学。注:材料可能是长度和内容的编辑。为进一步的信息,请联系引用源。
参考
Bernhard c . Stoeckle Sebastian Beggel亚历山大·f·Cerwenka Elena Motivans Ralph Kuehn Juergen感性。一个系统化的方法来评估环境条件对艾德娜检测的影响在水生生态系统的成功。《公共科学图书馆•综合》,2017;12 (12):e0189119 DOI: 10.1371 / journal.pone.0189119。
