南加州大学表观基因组中心选择新系统提供下一代数据管理解决方案

南加州大学的表观遗传学研究的丰富的历史可以追溯到1980年的发现azanucleoside药物对DNA甲基化的影响。南加州大学表观基因组中心成立于2007年,隶属于南加州大学诺里斯综合癌症中心进行高通量分析的遗传和表观遗传变化倾向和发展为癌症和其他疾病。

根据彼得·w·Laird博士南加州大学表观基因组中心主任,副教授,手术和生物化学和分子生物学,“我们需要一个集中的实验室和基因和新一代测序数据管理系统的研究,使我们的设备无缝地跟踪样品在许多项目和自动获取数据进行综合分析。Geneus满足这些需求。同时,我们考虑在选择的一部分GenoLogics是我们想使用一个供应商一个可伸缩的、适应性强的信息与我们的业务解决方案,它可以生长在未来和适应新的应用程序。”

Geneus GenoLogics“基因组学实验室和数据管理解决方案,架构来满足独特的基因组学研究设施,需要预先配置与集成许多技术平台包括下一代测序。现有集成Illumina公司的基因分析仪和BeadStudio系统意味着Geneus是南加州大学的表观基因组中心。还GenoLogics部署的web协作工具、LabLink设备将能够与它的客户和合作者分享结果。

“高通量研究设施,比如南加州大学表观基因组中心,Geneus提供了一种可伸缩的解决方案,可以提高操作和有效地管理他们的下一代测序和其他基因组学数据都在一个单一的系统,”萨尔Sanci说,在GenoLogics产品开发副总裁。“此外,我们开放的信息平台是高度可配置允许跨实验室仪器和其他系统的集成,使综合数据分析。”

Geneus GenoLogics实验室和数据管理解决方案,正在与Illumina公司LIMS集成软件,这将使自动化数据采集Geneus LIMS的进出。Geneus将主LIMS系统在实验室,它将管理所有收集的数据样本。因为Geneus也整合到基因组分析仪用来跟踪样品,管理数据、工作流和协议被基因组分析仪上运行。

Geneus预计将减少整体实验室的工作量,减少劳动与实验室相关的操作,因为它会自动的许多活动,目前正在进行手动操作。