维多利亚大学，CPTAC合作伙伴

维多利亚大学基因组英属哥伦比亚蛋白质组学中心与美国国家癌症研究所(NCI)合作，通过NCI的CPTAC分析门户网站(https://assays.cancer.gov/)．分析门户的一个关键方面是提供空间，让来自全球各地的国内外蛋白质组学研究人员可以上传和分享他们的定量分析标准操作程序和指南。

为了实现这一目标，NCI正在继续改进检测方法的上传过程，使公共/非cptac团队有一个独立的过程来无缝上传他们的检测方法，并将在这一努力的最新进展提供给社区。靶向蛋白质组学分析消除了通常使用传统蛋白质检测系统(如Western blotting)观察到的问题，这些问题充其量是半定量的，不容易复用，而且通常是非特异性的。

直到最近，数百个基于靶向质谱分析的非标准化信息分布在已发表的期刊文章中。CPTAC分析门户是高度特征的靶向MS分析的集中公共存储库，包括标准操作协议、试剂和分析特性数据。

加拿大维多利亚大学BC基因组蛋白质组学中心主任Christoph Borchers博士自愿成为第一个将靶向质谱分析上传到门户网站的非cptac研究人员。这些基于多重反应监测(MRM-MS)的检测完全符合CPTAC制定的标准和指南，并满足进入入口的最低特征描述要求，包括多点响应曲线的开发和可重复性评估。

在与生物学家相关的门户登陆页面中，研究人员将能够通过使用“非cptac”术语查询来搜索蛋白质组学中心的检测结果。Borchers博士在初始阶段为门户网站贡献了107个MRM分析，并正在努力完成多达2000个分析，最终将输入到CPTAC分析门户网站。“我们很高兴能与CPTAC在这一重要项目上合作，”Borchers博士说。

“如果基于质谱的蛋白质组学要用于临床分析，蛋白质定量的标准化是必不可少的。为了协助癌症相关研究，我们正计划大大扩展CPTAC中基于MRM的检测范围，以包括小鼠蛋白质的检测。小鼠是研究癌症的首选动物模型，通过新的CRISPR/Cas9技术将变得更加重要，该技术极大地促进了以低成本研究小鼠癌症相关蛋白的基因突变。”

Fred Hutchinson癌症研究中心成员、CPTAC检测开发工作组联合主席Amanda Paulovich博士指出:“我们很高兴迈出这重要的第一步，开放整个社区的检测门户，让我们更接近整个社区所有蛋白质标准化量化的目标，以提高蛋白质研究的分析严格性和可重复性。”