全基因组测序进一步揭示霍奇金淋巴瘤

由迈阿密大学米勒医学院西尔维斯特综合癌症中心、纪念斯隆凯特琳癌症中心和威尔康奈尔医学院的科学家领导的一个大型研究项目发现，全基因组测序(WGS)可以提供关于经典霍奇金淋巴瘤(cHL)的更多信息，而外显子组测序只能读取蛋白质编码基因。

研究小组表明，WGS可以更容易地检测DNA结构变异，如基因重复，并提供更精确的数据来跟踪与疾病进展相关的突变。这项研究发表在该杂志上血癌发现．

“我们发现，通过使用全基因组测序，我们几乎可以读取基因组中蛋白质编码和非编码区域的所有突变，以及结构和拷贝数的变化，”他说克雷格·莫斯科维茨，医学博士他是西尔维斯特癌症服务线的首席医生，米勒学院的医学教授，也是这项研究的合著者之一。“我们发现了许多以前从未记录过的基因组事件。这是我们发现的识别新的癌症驱动因素的最好技术。”

虽然外显子组测序非常富有成效，可以检测点突变和其他导致癌症的变异，但它描绘了一幅不完整的图景。非编码基因组区域的突变也可以控制基因表达。此外，WGS发现了广泛的结构变异，包括嗜色症，其中受损的染色体看起来就像被大锤击中了一样。

突变特征和肿瘤年代学

该研究在cHL中发现了许多这些问题，并发现了与化疗相关的突变特征。也许最重要的是，WGS提供了对癌症如何进化的时间见解。重建肿瘤年代学可以在治疗选择中发挥重要作用。

“了解肿瘤随着时间的推移是如何发展的很重要，”他说弗朗西斯科·莫拉，医学博士他是西尔维斯特骨髓瘤基因组实验室的联合负责人，医学助理教授，也是这项研究的第一作者。“我们需要知道哪些突变是以什么顺序获得的。如果我们开出一种靶向治疗，我们希望它针对的是整个肿瘤中共有的基因组改变，而不是后来出现的相对罕见的亚克隆。”

因为cHL细胞(称为霍奇金和里德·斯特恩伯格细胞)很罕见，很难研究，研究小组不得不发明一种复杂的分类系统，可以分离出足够多的cHL细胞。这些细胞后来被扩增以有效地测序。这种方法与WGS相结合，可以为cHL和其他癌症提供许多新的见解。

虽然这项研究对cHL有了新的认识，但这只是漫长过程中的第一步。这项概念验证研究将为对血液和其他癌症进行更深入的基因组研究提供早期模板。

癌症是一种极其复杂的疾病，我们在完全了解它们之前还有很长的路要走C. Ola Landgren，医学博士他是骨髓瘤研究所所长，转化与临床肿瘤学研究项目的联合负责人，也是这项研究的合著者。“通过利用WGS，我们可以更好地评估肿瘤的演变，确定结构问题，并有望获得新的治疗见解。”

参考:王志强，王志强，王志强，等。通过霍奇金和Reed Sternberg细胞全基因组测序揭示经典霍奇金淋巴瘤的分子进化。发现血癌．2023: bcd - 22 - 0128。doi:2643 - 3230. - 10.1158 / bcd - 22 - 0128

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