阿宝在水里是谁?
“在水里撒尿是谁?“可能是,背后有一个很大的科学问题。确定的来源粪便contamination-an重要公共卫生问题需要多年的研究。博士生玫瑰Ragot和教授理查德·Villemur研究所国家de la任职(inr)正致力于基因引物,短DNA序列测序作为起点。引物可以识别潜在的排泄物污染的来源,尤其是在流经城市和农业水环境。他们的工作发表在《环境监测和评估。
由于粪便污染扩散,可以有多个来源,从受灾地区几公里。因此正确的遗传指标必须管理这种污染的粪便中找到。例如,人类的污染可能表明错误的化粪池污水处理基础设施或泄漏。牛更容易被污染的来源字段径流或不良的肥料管理。
研究小组发现引物识别大多数哺乳动物和鸟类,排泄物污染的主要贡献者。
有效的DNA测序
这些引物作为一种阅读环境DNA分析按钮。测序完成使用PCR扩增,COVID测试中使用的相同的技术。DNA片段的引物告诉设备需要被复制大量的相同副本,以确定哪些物种存在。通过考虑所有物种,这种创新的方法消除了需要执行的PCR分析每一个可能的来源。
生物学博士生玫瑰Ragot取样四条河流来演示这些引物在现实条件下的有效性。她第一次分析了L 'Assomption水河,流经城市的Joliette之前跨越一个农业地区。她还把样品从河贝永,穿过一个农业区域上游Berthierville直辖市的牛、猪和家禽。
“人类和牛排泄物污染发现河L 'Assomption”Ragot说。污水系统溢出在几天前暴雨可以解释这部分高水平的污染。在她的博士学位,玫瑰Ragot继续分析这些河流近100个样本,与基金会合作河和流域组织在该地区。
除了跟踪的排泄物污染来源,引物用于确定哪些种类的哺乳动物和鸟类以及鱼类和两栖动物出现在环境。“我们可以概要物种,甚至知道他们的相对丰度基于DNA的百分比。跟踪更多的外来入侵物种的存在,更宽容的污染,例如,野生动物管理很有帮助,”Villemur教授说。Ragot和Villemur将探索这个应用程序在他们未来的工作。
参考:Ragot R, Villemur R·埃德娜的哺乳动物,鸟类,和鱼类线粒体地表水的宏基因组:源跟踪申请的排泄物污染地表水。环境Monit评估。2022年,194 (2):72。doi:10.1007 / s10661 - 021 - 09668 - w
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