为什么是危险的新病毒难以识别?

在最近出版的基本回顾致力于病毒感染的诊断,俄罗斯研究具有初期研究团队是第一个系统地描述和总结遗传学的快速发展领域的尖端技术。一些新的有效的病毒检测方法已经发展在过去的几年里,包括那些针对未知病原体。作者描述了所谓的高通量下一代测序技术作为一种有效的新方法。方法将彻底改变新的致病病毒的检测和分析,但它至少会几年,直到引入主流的临床实践。

为了应对快速COVID-19疫情的蔓延,一个权威的全球科学期刊,名为病毒,发表一个基本评论到新兴的病原体的鉴定和研究相关的问题,比如臭名昭著的冠状病毒。

“有各种统计估计,超过320000多种病毒感染哺乳动物,“卡米尔Khafizov说,初期的历史遗传学研究员放射性碳分析和应用物理实验室和评论的作者之一。“但是到目前为止,只有不到1%的在广大的群众进行了研究。”

大多数病毒,包括那些引起呼吸系统,消化系统,和其他疾病在人类中,保持unresearched因此几乎检测不到。这背后的原因是病毒的窄谱的现代测试系统的设计目标。

“比喻,我们正试图看大量的威胁通过一根针的眼睛,“作者写的评论。除了其他事情,他们探讨聚合酶链反应方法的缺点。这种微生物分子的基本技术测试未能识别差探索病毒,这构成了现代病毒学的关键问题之一。

然而,新方法,可能解决问题的检测和识别新的微生物,并审查了这些方法。作者认为下一代测序(上天)是最有前途的。也被称为高通量测序,它使多个并行DNA分子的分析,是一组样本,不同地区相同的基因组,或两者兼而有之。

“有效的数学算法的关键部分的方法,”艾琳娜Matsvay说,初期博士生和审查的通讯作者。“他们允许研究人员比较未知病毒的基因组和病毒基因组的所有可用的引用,并预测它的所有可能的特征,包括其致病潜力。”

门店的主要缺点包括高成本运行这些测试所需的设备和试剂和冗长的样品制备,测序和数据分析过程。这些限制,加上实验室人员资格要求高,防止广泛的集成方法在临床实践中的主流地位。然而,技术的成本和每年下降,虽然它的速度,精度和效率保持增长。

Khafizov指出,冠状病毒大流行已经证明的重要性,门店在临床样品和方法对于识别新的病原体研究病毒的分子机制从动物传染给人类。技术可能是认证用于卫生保健在不久的将来。

参考
目前的趋势在诊断病毒感染的病因不明。丹尼尔Kiselev et al . 2020年病毒,12 (2),211;https://doi.org/10.3390/v12020211。

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