自动化的蛋白质消化MS-based蛋白质组学应用程序工作流

基于质谱(MS)的自底向上的蛋白质组学是建立在大规模鉴定肽,并取决于蛋白质被蛋白酶已知的有效转换成肽特异性。最常见的制备方法在解决方案(ISD)或消化消化的蛋白质SDS PAGE凝胶上分离,为胶液消化(IGD)。这两种方法都由一个冗长的清洗和化学改性步骤序列。增加吞吐量和再现性,这些过程的自动化是非常满意。与其他„”使应用程序、蛋白质组学分析质/女士仍然耗时,测量管道的ratedetermining一步。因此,制备样品不需要很高,但相当medium-throughput设置。

正常的台式方法IGD和ISD适应使自动化机器人设置成为可能。此外,我们修改标准的伙伴机器人与真空室设置,可以控制机器人的软件和促进所需的大量的清洗溶剂移除IGD导致增强敏感性。