使用无标记方法的差分表达式分析和LC-MS数据相对定量的新软件

简介

DeCyder™MS差分分析软件(DeCyder MS)是一种用于LC-MS和LC-MS/MS数据的可视化、检测、识别和无标签相对量化的新工具。为了评估其定量能力，在复杂背景下，从表达不同水平二氢叶酸还原酶(DHFR)的大肠杆菌菌株中提取总可溶性胰蛋白酶消化蛋白，使用纳米液相色谱-质谱(nanoLC-MS/MS)分析。用DeCyder MS对全扫描质谱进行匹配和定量。第二个实验是在含有诱导整合酶的菌株上进行的。