改善小RNA图书馆工作流程准备下一代测序

下一代测序(上天)是用于分析微rna (microRNA的),一个类的小非编码rna是重要的治疗目标和诊断标志物。商用小RNA序列库制备包需要大量输入(> 100 ng)和一个艰难的凝胶纯化步骤。此外,商业工具适配器却阻碍了二聚体形成,5’和3’没有一个RNA干预插入适配器结扎。适配器二聚体优先在PCR扩增。这是加剧了RNA在低输入适配器二聚体的形成可以大大减少可用的序列读取。

我们描述一个抑制适配器二聚体的优化工作流程,适用于低RNA输入和消除需要一个凝胶纯化步骤。我们工作流程介绍了化学改性适配器,有效地形成库同时减少适配器二聚体的形成。TriLink RNA的修改工作流适配器允许输入低至1 ng不到1%适配器二聚体凝胶纯化时读取。此外,当我们的工作流结合bead-based大小选择净化、自动化成为可能。