小干扰RNA (siRNA)酶促生产数据库
能够特异性下调基因表达的分子是强大的研究工具。小干扰RNA(siRNA)是序列特异性基因沉默剂的最新曲目之一。这种方法的鲁棒性促使研究人员开发更便宜的替代品,以取代通常使用的化学合成siRNA试剂。
其中一种替代方法是核糖核酸内酶制备的siRNA (esiRNA)技术,以经济有效地生成用于哺乳动物细胞全基因组筛选的文库[1,2]。从细菌克隆中的cDNA文库开始,直到标准化到最终384孔板(包括4张质量控制图像)中等量的esiRNA文库的酶生产,在每个分子的关键生产步骤后,需要组织和跟踪大量数据。
在这里,我们介绍了Library Production (LP),这是我们实验室开发的基于web的工具,允许存储和集成来自生产过程的数据。LP工具是一个数据库,目前涵盖了三个文库的15,000 - 30,000个esiRNA分子,是技术开发工作室(TDS-LIMS)的实验室信息管理系统(Laboratory Information Management System)综合软件包的一部分。
其中一种替代方法是核糖核酸内酶制备的siRNA (esiRNA)技术,以经济有效地生成用于哺乳动物细胞全基因组筛选的文库[1,2]。从细菌克隆中的cDNA文库开始,直到标准化到最终384孔板(包括4张质量控制图像)中等量的esiRNA文库的酶生产,在每个分子的关键生产步骤后,需要组织和跟踪大量数据。
在这里,我们介绍了Library Production (LP),这是我们实验室开发的基于web的工具,允许存储和集成来自生产过程的数据。LP工具是一个数据库,目前涵盖了三个文库的15,000 - 30,000个esiRNA分子,是技术开发工作室(TDS-LIMS)的实验室信息管理系统(Laboratory Information Management System)综合软件包的一部分。
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