PredRet:保留时间的预测之间的直接映射多个色谱系统

要求在代谢组学研究的一个关键动力存储库的开发spectra1女士2和自动化工具来帮助复合identification3-5。但只利用碎片是忽略了一半在质可用的信息。保留时间(RT)同样重要。
LC系统目前没有协调一致的努力,分享和利用信息沿RT信息已经被忽视的原因是RT是特定于色谱系统(CS)和存在没有约定RT引用。
化合物在不同的CSs RTs的数据库开发。每一对的CSs, RTs是用来构造一个投影模型之间的RTs两个CSs。之间建立这些模型的所有CSs允许RTs的预测大量的化合物在CSs没有实验确定。
与当前小型数据库可以预测到400 RTs平均误差在0.01和0.11之间最小根据CS。预测的置信区间的平均宽度范围从0.1到0.8分钟。
免费、开源和基于web的工具可以在predret.org。