454测序系统帮助发现小说犬丙型肝炎病毒
本周在网上发表的一项研究在《美国国家科学院学报》上,研究人员报道利用高通量测序技术来确定一个小说在家犬丙型肝炎病毒。
新病毒,名叫犬hepacivirus (CHV),是第一个已知的实例hepatitis-like感染动物以外的人类和非人类的灵长类动物。
这种病毒给科学家的识别和表征的新见解丙型肝炎在人类是如何进化和提供科学家新的希望开发一个模型系统研究疾病。
人类丙型肝炎病毒(HCV)在全世界影响大约2亿人。据疾病控制和预防中心(CDC), 320万人在美国是慢性感染。
直到最近,研究丙型肝炎的起源以及它如何导致人类疾病密切相关的没有病毒和缺乏动物和细胞培养模型。
领导的研究中,研究人员从中心的感染和免疫在哥伦比亚大学和爱丁堡大学的,开始作为一个调查描述呼吸道病毒感染家犬。使用高通量测序与GS FLX系统,从454年生命科学,罗氏公司的研究人员发现一个未知的hepacivirus更类似于丙肝病毒比迄今发现的。
进一步分析确定,如丙肝病毒,CHV的基因组包含基因组规模下令RNA结构(工资),二级结构允许病毒慢性感染他们的自然宿主。此外,序列的基因编码的蛋白质参与病毒感染和复制是丙肝病毒和CHV之间非常相似。
研究发现表明丙肝病毒可能被引入到人类与狗接触,而且它可能比之前认为的更广泛地分布在哺乳动物物种。
“CHV信号的识别和表征的出现,一个新的、驯良的丙型肝炎动物模型,”伊恩·利普金博士说,中心主任感染和免疫在哥伦比亚大学。“这一发现提供了新的工具,了解这种病毒导致疾病,并将促进药物和疫苗研究和开发。
“使用强大的基因技术,研究人员开始了解细菌和病毒的多样性的生态系统,我们周围的生活,在美国,在美国,甚至在我们的宠物,”克里斯托弗·麦克劳德解释说,总裁兼首席执行官454生命科学。“这惊喜的发现是另一个例子454测序系统研究人员提供一个强大的工具来检测新型病毒在范围广泛的宿主和病原体。”