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可负担的,基于云的DNA测序服务宣布


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英伟达(NVIDIA)今天宣布,全球最大的基因组学研究所华大基因(BGI)将推出一项服务,使全球研究人员能够在云中执行负担得起的下一代测序(NGS)生物信息学分析。

总部位于中国深圳的华大基因推出了新的“EasyGenomics”服务,将直观的用户界面与华大基因的自动化管道分析、软件和工具结合起来。它们与业界最大的测序平台集成,提供生物学家、生物信息学家以及最终医生需要提交和接收的DNA测序数据的自动化分析。

通过NVIDIA gpu的加速,与基于cpu的系统相比,DNA大数据分析的处理速度从几天缩短到几个小时,EasyGenomics极大地扩展了全球研究人员先进基因组学研究能力的可用性,使科学更接近负担得起且可行的个性化医疗时代。

华大基因今天将在2012年生物信息技术世界会议和博览会上为合格的生物学家和生物信息学家提供这项新服务的限量免费试用。欲了解更多信息或申请,请访问EasyGenomics网站。

华大基因副总裁方林博士说:“通过使更多的研究人员更容易、更经济地加速DNA测序数据,我们希望有助于促进基因组学作为医疗保健的实际组成部分用于临床诊断,以及复杂疾病的研究。”“GPU加速使科学家能够以前所未有的速度分析DNA测序数据,将时间从5天缩短到5小时。一旦完全部署在云端,我们预计EasyGenomics有一天会彻底改变基因组学研究。”

EasyGenomics云服务具有由NVIDIA(R) Tesla(R) M2070和M2075 gpu支持的混合计算系统,可与系统cpu一起加速DNA测序数据分析。华大基因计划在EasyGenomics服务完全部署后,再升级数百个NVIDIA Tesla gpu,届时有望支持数千名用户。

“由于测序成本迅速下降,今年可能成为1000美元基因组的一年。我们很快就会淹没在基因组测序仪的数据洪流中,”英伟达特斯拉业务高级总监Sumit Gupta说。华大基因的EasyGenomics服务利用GPU计算的力量,为科学家们提供一种负担得起、易于使用的方法,来解决这个新的基因组大数据问题,让我们更接近有效、负担得起的个性化治疗。”

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