Affymetrix型阵列技术力量新出版的移植基因

Affymetrix公司宣布其公理®高通量基因分型技术在两个移植同行评议的出版物发行的一个国际研究小组在本月的外科医生和科学家。财团——国际遗传学和转化研究移植网络(iGeneTRAiN)——由佩雷尔曼医学院的研究人员共同在宾夕法尼亚大学,旨在改善移植成功通过免疫标志物的发现和深入了解的基因因素,特别有助于移植排斥移植或其他并发症。最终的网络旨在应用发现基因组移植排斥的基础诊所为了提高移植成功。第一阶段的工作,包括开发和测试的高密度覆盖超过780000个变异的基因序列,提出了一对本月发表的论文在基因组医学和移植》杂志上。

第一篇论文,”概念和设计的数组为Transplantation-Specific型全基因组关联研究”发表在10月份发布的基因组医学和描述公理平台上开发数组的内容transplant-related强大和具有成本效益的大规模基因分型的研究。自定义数组组成的定制内容深入捕捉变异在人类白细胞抗原(HLA)杀伤细胞immunoglobulin-like受体(吉珥),药物基因组的基因,在移植和代谢基因座重要。这是第一个调查包括non-HLA遗传因素器官移植后的临床结果。

直到现在,找到捐助者与受者的HLA基因是一个很好的匹配标准的做法,但仍拒绝发生在高百分比的移植患者尽管匹配。这项新研究的重点是寻找额外transplant-related基因;这包括研究的基因,影响免疫抑制剂药物的代谢。

“基因数据集我们放在一起在这个项目是迄今为止最大的聚集在移植基因组学,”布伦丹·j·基廷说,研究助理教授DPhil移植手术在佩雷尔曼医学院的宾夕法尼亚大学。“这个数组的发展之前,是不可能看所有这些标记在一起。”

Affymetrix贡献额外的~ 350000个snp Caucasian-European和非欧洲人口改善平均覆盖率达到主要的种族,包括非洲和亚洲。这些snp与创建全面的重叠的目标选择与现有数据生成的英国生物库使用英国生物库公理数组和Affymetrix Axiom生物数组,使关节或荟萃分析的样本基因分型和其他传统GWAS平台。

第二出版”,设计和实现国际遗传学&转化研究移植网络(iGeneTRAiN)”发表在10月份发布的《移植和描述这个数组技术的应用更多的研究和移植的研究人员对不同样本的基础。财团已经生成的基因组和结果数据为32000多个器官捐赠者和接受者。发现财团将提供洞察基因组不相容的捐助者与接受者(dr)对移植前和促进提高dr匹配,以及确定治疗目标和提供的信息可以用于个性化的免疫抑制疗法的发展。

Affymetrix商业化数组,将用于进一步的研究,并最终产生关联,将应用于个性化和precision-oriented基因组工具来解决临床问题和改善病人在移植的结果。

”我们很高兴提供了技术平台对于这个开创性工作,”劳伦Bellon说,博士,高级副总裁兼总经理,Affymetrix型业务单元。“Affymetrix商业化这个数组,我们调用Axiom®移植基因分型数组,我们介绍它在本周ASHG。”