Affymetrix介绍Axiom基因组分析的几种标记移植型数组
数组包含~ 780000标记,包括超过30000个变异可能导致移植排斥反应或其他并发症。研究人员也发现数组用于免疫学的研究,疾病和药物治疗;可能进行荟萃分析,结合数据与其他基因型数据库如英国生物库队列,500000多名志愿者的基因的集合使用Affymetrix英国生物库Axiom数组。
目前,选择捐赠的人类白细胞抗原(HLA)基因是一个很好的匹配与移植受者HLA分子类型的标准护理。研究这一新的移植阵列主要用来寻找额外transplant-related变异提供洞察移植物抗宿主病的早期诊断以及基因标记与免疫抑制药物代谢有关。此外,Affymetrix Axiom HLA分析软件使负担得起的,高通量,准确分析11古典基因座的四位分辨率从Axiom array-generated将HLA型基因型数据。
“高保真公理数组的组合技术,强大的公理™分析套件,Axiom™HLA分析软件,和集成的能力从英国生物库使病人数据移植基因组分析,没有见过的,”评论Laurent Bellon博士,高级副总裁兼总经理,Affymetrix型业务单元。“这些工具的应用程序提供了一个非常具有成本效益的方法,可以推动发现潜在的改善患者的结果。”
Axiom移植型数组是国际遗传学和转化研究开发和测试在移植网络(iGeneTRAiN),佩雷尔曼医学院的研究人员共同的宾夕法尼亚大学。团队两个同行评议的出版物发表在10月的项目。
“基因数据集我们放在一起在这个项目是迄今为止最大的聚集在移植基因组学,”布伦丹·j·基廷说,研究助理教授DPhil移植手术在佩雷尔曼医学院的宾夕法尼亚大学。“这个数组的发展之前,是不可能看所有这些标记在一起。”
Affymetrix贡献额外的~ 350000个snp Caucasian-European和非欧洲人口改善平均覆盖率达到主要的种族,包括非洲和亚洲,以及大量的内容从Axiom基因组数据库的各个功能模块。这些单核苷酸多态性与创建全面的重叠的目标选择与现有数据生成使用英国生物库Axiom数组和公理生物基因分型数组,使关节或荟萃分析的样本基因分型用这些工具以及其他传统GWAS的工具。