安捷伦推出下一代ChIP-on-Chip分析微阵列
安捷伦科技公司已经宣布的可用性低聚糖制成ChIP-on-chip(染色质免疫沉淀反应芯片)微阵列密度超过先前的产品增加了六倍。
高密度微阵列补平台的灵敏度和重现性,让研究人员进行基因组花砖实验。
这些芯片有两种格式:一个微阵列每张幻灯片每张幻灯片244000特性或四个微阵列与44000年每个特性。
“研究人员认识到,拥有更多的功能/数组增加效率,因为它们使用更少的幻灯片,”凯文说Meldrum,安捷伦基因组学营销总监。
“他们也承认更多的特性并不一定意味着更精确的测量。”
“瓷砖实验需要优化探针设计与ChIP-on-chip检测绑定事件。我们阵列密度,灵活性和敏感性,这些调查人员的需求。”
ChIP-on-chip试验用于检测蛋白质,包括但不限于转录因子,绑定到特定区域的DNA在整个基因组。
常见的应用包括表征转录,DNA复制和DNA修复事件;染色质的修改的映射如DNA甲基化;测定方法和治疗性化合物和目标基因之间的相互作用;和验证的基因表达数据。
“这种技术在世界范围内被迅速接受,”里Saxena说,安捷伦产品经理。
“ChIP-on-chip提供了生物学见解,之前还没有被完全使用基因表达。”
“我们调查目前集中在ETS基因家族作为一个模型系统,和转录因子特异性的问题核心的控制细胞生长和分化以及misregulation这些过程在肿瘤形成过程中,“芭芭拉·格雷夫斯博士说,肿瘤学系的主席洪博培癌症研究所。
“安捷伦ChIP-on-chip平台使我们能够绑定事件在全球范围内进行调查。”
一篇论文的鲁道夫Jaenisch实验室怀特黑德研究所,在4月19日的问题自然描述了胚胎干细胞的监管。
使用安捷伦ChIP-on-chip,研究人员发现调控蛋白,抑制特定基因,反过来,在开发过程中保持胚胎干细胞多能性。
在7月28日出版的一篇论文科学,从里克年轻实验室在怀特黑德研究所,描述了研究人员发现了一个异常ChIP-on-chip申请。
他们目前的证据表明,大多数增殖蛋白激酶和蛋白激酶与基因相关的子单元成为身体调节在酵母基因组中。
“我们认为这一发现对生物学和医学有深远的影响,”年轻的博士说。
“激酶调节细胞生长和发育的各个方面,重要的是要理解他们是如何控制我们的基因。”
“制药公司已经投入相当大的精力发展特定激酶的药物,一些已经涉及人类疾病如癌症。”
安捷伦的60米探针设计提供敏感性竞争平台,使研究人员能够检测绑定事件没有复杂的统计分析和数据平滑。
调查人员还可以访问安捷伦广泛的瓷砖的数据库优化探针在人类的基因组(~ 1300万探针),鼠标(~ 1300万探针),鼠(~ 1000万调查)和其他通过eArray生物模型,设计基于web的工具,有助于方便数组定制。
安捷伦的ChIP-on-chip阵列组合包括人类、小鼠和斑马鱼子数组秀丽隐杆线虫,果蝇,拟南芥和酵母全基因组阵列。
”4-array格式允许人员运行四个样品在一个幻灯片,大大减少实验的总成本,“Saxena说。
”例如,人员在酵母社区将能够研究四个不同的条件对四个全基因组,只需使用一个滑。”