安捷伦推出在线微阵列设计工具与探针设计能力

安捷伦科技公司日前宣布,其安全的在线定制芯片设计工具现在包括探针设计能力。

eArray v4.5开发旨在使科学家能够利用灵活性、敏感性和密度的增加安捷伦60米SurePrint微阵列的具体实验。

今年7月,安捷伦开始航运其下一代SurePrint DNA微阵列包含244000特性标准1 x 3”幻灯片,优化基因表达等应用程序,基于阵列比较基因组杂交(aCGH),染色质免疫沉淀反应芯片(ChIP-on-chip),微rna剪接变异分析、DNA甲基化和研究。

“执行基因表达的能力调查设计在线客户将节省大量的时间和金钱,”斯科特·哈里森说,安捷伦定制芯片市场经理。

“研究人员现在可以使用eArray v4.5开发快速设计探测目标序列没有成本,但他们可以选择安捷伦设计调查。”

“我们的顾客比以往任何时候都更接近一种无拘无束的能力来设计和制造任何探针为任何应用程序和基因组。”

安捷伦科技公司声称,eArray v4.5开发用户可以查询数据库包含2100万瓦CGH ChIP-on-chip探针,允许他们创建专门针对高分辨率阵列基因感兴趣的区域。

调查图书馆安捷伦的整个投资组合的目录微阵列可以浏览、下载、保存并重新为客户设计。

eArray v4.5开发基于web的应用程序,旨在使研究人员能够设计自己的微阵列许多格式,然后提交打印请求直接生产设施的便利。

eArray v4.5开发包含全基因组芯片老鼠和人类探测数据库,每个包含1300万个探针,老鼠和人类探测数据集的800万调查全息应用程序。

设计工具提供了增强的搜索功能来访问这些数据集用于高密度aCGH和ChIP-on-chip实验。

此外,eArray v4.5开发提供了工具,使客户上传自己的基因表达,aCGH和ChIP-on-chip调查内容,microarray-creation过程的一部分。

除了上述生物模型和功能,安捷伦基因组数据集可以通过eArray继续扩张。最近添加:

——恒河猕猴——第二代恒河猕猴芯片开发的迈克尔·卡茨实验室和灵长类动物基因组学部门的华盛顿国家灵长类动物研究中心华盛顿大学,现在是可用的。

基于贝勒恒河猴基因组计划序列,该微阵列包含22559 60米益生元序列对应于17173种不同恒河猕猴基因,468人类基因,96病毒基因(代表27个不同的病毒)和350人的小分子核糖核酸。

安捷伦提供探针设计服务和现场校准的合成微阵列用于制造和测试新恒河的数组。

灵长类动物基因组学部门负责人卡茨教授开发的第一个商业恒河macaque-specific寡核苷酸微阵列在2004年秋季,与安捷伦科技公司合作。

恒河猕猴是灵长类动物模型用于研究人类疾病和发展,特别是艾滋病毒和艾滋病。

因为没有商业恒河猕猴微阵列直到去年,恒河猕猴人员局限于研究一个基因或使用人类的微阵列。

卡茨实验室bioinformaticist吉姆•华莱士领导新恒河芯片项目,说,“我们得到了很好的支持斯科特·哈里森和安捷伦eArray小组从最初的概念到生产和测试的新数组中。”

——牛。“牛”是一个农业和经济上重要的畜牧物种,也是一个有用的大型动物模型的代谢和生殖研究。

牛微阵列,由ViaLactia生物科学与安捷伦科技公司合作,包含21.475独特的60米探针,代表大约19500个不同的牛的基因。

450000信使rna探针是由集群和EST序列可以从公共资源和ViaLactia专有的数据库,并辅以假定的转录序列被NCBI的第二稿牛基因组(Btau 2.1)。

牛microrna由219阵列探测器。大多数的调查目标序列是由生物学家和专家广泛策划包含密集的功能注释来源于人类orthologues。

这个芯片是第三代牛微阵列的设计和延续发展开始ViaLactia和安捷伦2001年2月。

500阵列和验证了三个独立的实验室用于基因表达分析和全息应用程序。

——狗。“犬属后裔”(国内狗)是一个重要的生物医学研究生物体在心脏病,癌症,糖尿病,行为紊乱,毒理学和许多其他人类条件怀疑基因起源。

几个世纪的选择近亲繁殖和产生的狭窄的基因池相关的个别品种特定品种具有独特的对某些疾病的易感性,使他们特别有用研究这些疾病的遗传基础的狗和人类。

每个44290 -特性微阵列包含42034个探针预测犬属后裔的基因。

序列和注释信息是基于犬基因组从公共数据源RefSeq(6)发布,Unigene(构建# 12)运用(32)发布,和TIGR(版本6,2005年1月)。

安捷伦科技公司开发该微阵列的内容与约翰霍普金斯大学医学院的研究人员。

没有使用eArray安捷伦客户成本。eArray可以访问earray.chem.agilent.com/earray。