安捷伦的Spectrum Mill搜索现在在蛋白质组软件的Scaffold 2.1中得到支持

安捷伦科技和Proteome Software宣布，Proteome的Scaffold 2.1软件现在支持处理来自安捷伦Spectrum Mill蛋白质数据库搜索引擎的搜索结果。

Scaffold从串联质谱数据中统计验证多肽和蛋白质，结合多个搜索引擎的结果，并以生物学相关格式图形化显示识别。Spectrum Mill执行MS和MS/MS数据的高通量蛋白质数据库搜索。

将Spectrum Mill数据文件加载到Scaffold的研究人员现在可以将Spectrum Mill结果与Mascot, SEQUEST, Phenyx, OMSSA和X的结果进行比较!串联搜索引擎。

“通过支持Spectrum Mill搜索引擎，Scaffold为其武器库增加了另一个优秀的工具，使研究人员更容易组合、比较和共享MS/MS搜索结果，”Proteome Software的科学家克里斯托弗·梅森(Christopher Mason)指出。

安捷伦实验室研究员Alex Apffel博士说:“结合搜索引擎数据产生的结果比使用任何一个搜索引擎得到的结果要好得多。”“用户可以‘拯救’原本会被拒绝的光谱，并为评估结果提供客观的统计基础。”

安捷伦实验室是该公司的中央研究机构，与Proteome Software合作，通过集成Spectrum Mill和Scaffold帮助研究人员获得更高质量的数据。MassHunter工作站的新版本Spectrum Mill提供了许多功能:

•接受大多数质谱仪器的数据;

•是少数几个利用MS和MS/MS谱中的高质量精度数据来提高搜索结果的特异性和置信度的程序之一;

•允许识别意想不到的蛋白质修饰;而且

•提供卓越的可视化工具，以帮助自动和手动验证，检查搜索结果和显示差异表达式。