艾伦细胞类型数据库启动

首开先河的数据库的单个神经元使科学家理解大脑的基本构建块

艾伦脑科学研究所今天宣布,它正在采取重大的科学的第一步,创建一个可搜索的标准数据库与艾伦的推出对大脑细胞类型数据库。这第一个版本包括位置信息,超过240个神经元的电活动和形状。

“大脑研究中取得进展,我们需要建立标准全世界所有神经科学家分享,”艾伦·琼斯说,博士,首席执行官艾伦研究所。“这些细胞可能在神经科学扮演相同的角色在化学元素周期表”。

公开访问数据库代表的第一个成果艾伦研究所的十年计划了解大脑的活动导致感知、决策和行动。理解大脑细胞类型的建筑块基本理解如何健康的大脑功能和疾病,如自闭症、出错阿尔茨海默氏症和帕金森氏症。

“识别神经元细胞类型必须解开神秘的大脑如何处理信息和产生知觉,记忆和意识,“创造者科赫说,博士,总裁和首席科学官艾伦脑科学研究所。“这是第一资源的汇集多种类型的data-shape,在大脑中的位置和电气活动一个可搜索的数据库地球上任何地方。”

艾伦细胞类型数据库包含详细的个人信息从鼠标视觉皮层神经元。他们的电活动,以应对刺激适用于细胞体和微电极记录在他们的形状被捕获在高分辨率光学显微镜。数字化重建细胞释放的一个子集的形态以及不同类型的计算机模型能够真实地模拟这些细胞的电行为也将可用。

包括在释放艾伦软件开发工具包(SDK):同伴源代码存储库包含神经元的细胞模型。这个工具允许科学家下载模型和运行自己的虚拟实验。

“数据库中的每个单元都有一个关联模型的电活动,可以下载作为艾伦SDK的一部分,“说Chinh见鬼,艾伦脑科学研究所的首席技术官。“模型允许感兴趣的科学家不只是观察单个细胞的模式,而是使定量和分析比较,最终帮助区分细胞类型。”

未来的数据发布这个产品将包括人类大脑皮层细胞和单个细胞基因表达的信息。

额外组件的数据版本是艾伦研究所最新的科学小插图:一个动态的动画,指导用户通过鼠标视觉皮层的细胞类型分类的基础上分析了成千上万的基因表达单一的神经元。大约1600个细胞的基因表达数据的动画也将可用。资源展示的那种未来的见解,可以从结合形态学、电和转录分析。“现在通过这样的一个数据库可用,我们正在建立一个基本的框架,允许我们说同样的语言,帮助更大的社区在神经科学回答未来的问题,”琼斯说。

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艾伦细胞类型数据库