阿特拉斯生物学实验室扩大服务在高通量分子遗传学SNP-genotyping基于女士

通过引入Sequenom的MassARRAY®分析仪用于DNA分析,阿特拉斯生物学实验室GmbH是一家旨在扩大其在分子遗传学范围的服务。Sequenom的MassARRAY®系统包括一个高通量平台利用matrix-assisted激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)的基因的单核苷酸多态性(snp)。

系统可用于验证潜在生物标记物被下一代测序,对精品的全基因组关联研究(GWAS)映射定义的应用程序使用的数据和SNP面板。系统的特殊的灵活性允许快速的采用新发现的生物标志物在小说或现有的生物标志物面板。

质谱只需要很少量的基因组DNA,提供精确的量化结果,从而为遗传物质的分析提供实实在在的利益。直接检测方法可以发现甚至低频率突变,这可能不被发现。此外,不仅可进行pcr与新鲜和冷冻材料,而且还与formalin-fixed石蜡包埋组织样本(FFPE)。自DNA纯化FFPE材料通常是高度退化,只有少量,这些样本的分子分析是有限的,当使用传统的方法。

“我们兴奋MassARRAY®系统,这将帮助我们为客户提供有价值的服务。系统是一个理想的补充我们的范围的服务,”彼得纽伦堡教授说,阿特拉斯生物学实验室的首席执行官。例如,MALDI-TOF女士是极其宝贵的GWAS后SNP基因分型,一个字段中ATLAS生物学实验室是欧洲领先的服务提供商之一,因为它证明了经验与全基因组SNP芯片技术从Affymetrix Illumina公司。此外,通过结合MassARRAY®系统与Sequenom OncoCarta™面板* *,ATLAS生物学实验室现在能够快速监测致癌基因的突变体细胞。

“OncoCarta™是目前唯一面板罕见的体细胞突变分析,提供快速并行分析238年19常见的致癌基因突变,”Michael Monko说Sequenom高级副总裁,销售和营销。“我们期待与阿特拉斯生物学实验室密切合作以确保更在欧洲研究人员访问这些创新技术,不管他们是否在基础和临床研究工作或在药物开发。”

MassARRAY SNP基因分型系统

基因分型结果的MassARRAY®平台与iPLEX®黄金分析* *是一个完整的基因分型解决方案验证和良好的映射的单核苷酸多态性,体细胞突变。该系统包括软件,可以自动设计引物多路复用化验。

在随后的反应,引物延伸到检测单核苷酸的序列差异水平。扩展后,发现产品芯片阵列,然后放在MALDI-TOF质谱仪。384 -位置数组通常在45 - 60分钟处理。

结果会自动加载到一个数据库,允许方便的数据分析。pcr反应可以用40多路单核苷酸多态性在每个反应,导致吞吐量水平每天高达150000基因型/仪器。