BioDiscovery发布Nexus拷贝数7.5版
BioDiscovery公司已经宣布释放Nexus拷贝数的7.5版本软件,序列和结构变化的主要平台进行分析从微阵列和门店平台。
版本7.5引入了一个新的门店模块进行分析的序列变异数组或门店平台,从测序数据的拷贝数和检测。Affymetrix扩展支持的软件平台支持OncoScan™FFPE试验装备和Affymetrix Axiom®人类基因分型数组。
引人注目的案件审查工作流特性包括新的过滤器快速减少变化潜在的致病性,包括三个分析过滤器移除从渊源者父母的电话,并且能够显示之前的样品含有一种变体。
对于癌症的应用程序,改进包括ASCAT 2.1,不需要匹配正常,并且能够从全基因组和whole-exome测序检测基因拷贝数异变。
“我们看到显著增加兴趣获得从测序数据拷贝数和我们已经介绍了一些方法在Nexus拷贝数7.5,“热天Shams博士说,首席执行官BioDiscovery公司。”我们也实现了一个2.1版本的ASCAT复杂的肿瘤样本没有正常配对,添加了许多功能细胞遗传学用户速度情况下评论,介绍三分析功能,并添加了许多小的可用性增强。BioDiscovery致力于简化数据分析为最终用户,将继续扩大产品与解决方案,发展变化的技术。”
Nexus拷贝数的独特特征的综合分析允许识别的序列变异重复拷贝数畸变或纯合子的地区和与7.5版本集成是采取更进一步的关系数据库存储和查询序列变异的基因数据存储库。
用户可以搜索广泛联系DB库(包含数据来源如TCGA、地理、阿格雷,和ISCA)序列变异,杂合性丢失,拷贝数变化发现先前的报告病例或类似的畸变概要文件以及其他疾病。
BioDiscovery Nexus拷贝数可以集成和流程在一起,在一个项目中,数据从数组商业平台如安捷伦,Affymetrix, Illumina公司、罗氏罗氏,自定义数组和下一代的数据平台,如离子激流,Illumina公司MiSeq, HiSeq,完整的基因组学等。
软件适用于许多类型的研究从关注项目的cytogeneticist大规模癌症或GWAS研究。BioDiscovery适应这些不同的需求,提供产品以灵活和模块化系统允许用户创建配置,适合他们的需要。