Bruker Daltonics在HUPO 2007上介绍了几种蛋白质组学功能和解决方案

在人类蛋白质组学组织(HUPO)第六届世界大会上，Bruker Daltonics在周一和周三的两次Bruker午餐研讨会上宣布了蛋白质组学质谱的几种能力和解决方案，以及40多份科学口头和海报贡献。

Bruker Daltonics声称，他们是第一家将ETD(电子转移解离)引入其商业高容量陷阱的公司，并且迄今为止拥有最多的ETD客户安装。随着新的Compass™1.3离子阱软件的发布，Bruker的大容量阱HCTultra PTM发现系统™成为第一个完全配备ETD和PTR(质子转移反应)的商业质谱仪。使用离子光学设计和化学设置的ETD/PTR允许常规自上而下的大肽和中等大小的蛋白质在高容量离子阱具有卓越的灵敏度的表征。

ETD/PTR的有用性通过翻译后修饰的表征得到了证明。Compass 1.3还引入了名为PAN™的CID碎片模式，该模式消除了MS/MS中离子陷阱的低质量截断。它可以在布鲁克的高容量离子阱系统上进行多种定量蛋白质组分析。此外，Compass 1.3中一个新的AutoMSn模式，称为“ActiveEjection”，自动消除最丰富的离子，以进一步增强动态范围。

最后，Compass 1.3中的“计划目标列表”扩展了每次运行可能的MRM转换的数量。这种新的动态调度可以同时监测数百种目标化合物，用于大规模生物标志物验证研究或用于农药、药物和兴奋剂筛选。

凭借其新的ProteinScape™2软件，Bruker Daltonics引入了下一代生物信息学平台，以满足科学家目前在生物标志物分析、量化和验证方面的需求。作为定性和定量LC-MS/MS蛋白质分析的全面解决方案，ProteinScape 2支持所有当前的标签化学，包括多路标签，以及无标签定量。

ProteinScape 2有许多专用的数据查看器，可以对蛋白质组学实验的每个级别进行评估和验证，例如LC/MS调查查看器、凝胶查看器和序列注释的MS/MS光谱。所有这些视图都有链接，允许简单浏览科学家的蛋白质组学数据，并支持广泛的查询。

ProteinScape 2处理管道采用“HUPO脑蛋白质组学项目处理指南”(forum.hbpp.org)，并将促进遵循HUPO/PSI发布指南的项目数据的直接提交过程。

通过Bruker Daltonics MALDI分子成像™系统获得的生物标志物发现的最新数据，证明了MALDI-TOF和MALDI-TOF/TOF(如上图所示的ultraFlex™III TOF/TOF)直接组织分析的强大功能。完整的Bruker解决方案包括新的ImagePrep™设备，用于组织上的自动化高分辨率基质应用，SmartBeam™激光技术和ClassImaging™算法，用于组织分类和生物标志物检测，分子组织学以及药物开发中药物和代谢物分布的成像。