力量发射timsTOF fleXTM ESI和MALDI SpatialOMx™
timsTOF fleX
答:SpatialOMx™生命科学和转化质谱成像
力量介绍了小说timsTOF fleXTM质谱计,包括适应software-switchable MALDI来源ESI timsTOF ProTM平台。这种新的ESI / MALDI功能允许在组学相结合,SpatialOMxTM,在一个乐器。timsTOF fleX有力量的专有10 khz SmartBeamTM三维激光与真正的像素富达快速,label-free MALDI成像高空间分辨率,在充分保留未经雕琢4 d蛋白质组学和phenomics敏感性ESI timsTOF Pro的模式。
这种独特的SpatialOMx方法,研究人员获得洞察空间分子分布在从MALDI成像,组织指导4 d组学分子表达的研究,如蛋白质,低级癌症抗原肽脂质、聚糖、代谢物,或外源性物质,不能观察到传统的染色或标签技术。MALDI-guided SpatialOMx允许针对特定的细胞为后续ESI-TIMS / PASEF-based群体或dia 4 d蛋白质组学或4 d lipidomics /代谢组学。两人现在可以执行在一个健壮的工具,timsTOF fleX,超高灵敏度的需要推进单细胞生物研究,作为一个完美的补充RNA-seq单细胞转录组。
蛋白质组学中心主任理查德·德雷克教授在南卡罗莱纳医科大学的,说:“我们的数据样本使用新的timsTOF fleX系统是前所未有的空间分辨率和多糖的深度报道。作为聚糖正在成为组织和血清中潜在的临床标记监控整体免疫状况,健康或不健康的老龄化,timsTOF flex的独特功能将极大地促进这些努力。timsTOF flex允许我们累积的方法开发了癌症和免疫疗法的组织和biofluid分析收敛在一个平台上。我可以看到无限类乐器的应用在许多研究领域快速多糖组织成像和biofluid 4 d组学分析”。
Rohan Thakur博士,执行副总裁力量Daltonics,补充道:“大多数组织蛋白质组学研究融合细胞的不同亚类,与一个不受欢迎的平均效应,掩盖了很多重要的生物学和病理学。MALDI-guided spatialOMx spatially-defined timsTOF fleX允许分析的组织区域,从而允许后续4 d蛋白质组学有选择地程控亚群体的目标。健壮,超高灵敏度timsTOF fleX桥梁之间的分裂分子组织成像和体液分析提供nanoLC-TIMS-MS /女士在同一仪器。这种独特的结合将使timsTOF fleX在4 d蛋白质组学的一个宝贵的研究工具和phenomics,以及推进单细胞生物,pharmaco-proteomics,平移4 d cross-omics工作流在大细胞数量或病人军团。”
力量也推出IntelliSlidesTM专门设计自动化timsTOF fleX工作流。IntelliSlides找pre-inscribed software-readable教标志的导电表面来表示将组织样本,条形码和跟踪号码。从示例加载IntelliSlides自动化去除效率低下的来源,因为他们本身就是正确地贴上标签,导向正确,MALDI图像配准发生在触摸一个按钮。用专门的软件,现在IntelliSlides MALDI成像对每个人来说都更容易。
此外,力量介绍SCiLS实验室2020 MALDI成像软件,现在结合MetaboScape5.0提供自动注释的脂质和代谢产物在spatialOMx组织分子图像。这种独特的组合自动匹配离子测量组织代谢组学和分子信息lipidomics工作流,强调生物相关通路信息使用MALDI成像。
博士丹尼尔·克鲁格,亥姆霍兹制药研究所助理教授萨尔(臀部)评论道:“我们用质谱和空间代谢组学在医药领域的研究。这包括特别是myxobacterial次生代谢物的分析小说天然产品。我们实验室多年来一直使用力量的仪器和软件,尤其是SCiLS实验室和MetaboScape。新的分子成像工作流集成这两种软件解决方案极大地简化和加快了整个MALDI成像管道。它将离子图像转化为分子影像与信心带注释的分子。”
新的工作流集成成像和代谢组学还支持数据从力量scimaX™mrm平台,以及新的timsTOF fleX。MetaboScape独特的霸王龙2 d算法进行特征提取,de-isotoping,离子反褶积谱图像数据集。在MetaboScape、分子功能注释是基于准确的质量和同位素富达使用SmartFormulaTM和分子信息,例如从公共数据库HMDB和LipidMaps等。MetaboScape现在也提供了独特的能力来增加ID得分信心通过整合准确商旅碰撞截面(CCS)从timsTOF分析。识别流回SCiLS实验室完全注释分子图像。SCiLS实验室是女士的市场领先的软件成像,而MetaboScape代谢物标记的识别软件解决方案的选择和路径映射……
b . 4 d蛋白质组学和4 d Phenomics创新
diaPASEF MBR-ddaPASEF 4 d蛋白质组学的进步
力量的革命timsTOF™Pro下一代nLC-TIMS-MS /女士4 d蛋白质组学已进一步加强PASEF结合data-indepedent (DIA)收购,在diaPASEF超高灵敏度自下而上的蛋白质组学。而无与伦比的频宽比视数据采集(DDA) PASEF显著提高灵敏度和深度报道使用短nanoLC运行时,基于块的随机性质导致缺失值,问题明显改善diaPASEF工作流、或match-between-runs ddaPASEF (MBR)。
这部小说diaPASEF1工作流,在asm 2019在制品可用于方法开发客户,使用重叠的窗口在离子迁移域触发MS / MS,有效地使用在高灵敏度四极离子传输的前身。通过使用PASEF的固有频宽比优势,新diaPASEF工作流通常导致了30%的性能提高,现在有超过7000的蛋白质中确定一个120分钟的单发实验200 ng希拉消化注入。数据分析,包括4 d功能对齐质量,保留时间,离子迁移率和强度,使用新的Mobi-DIK执行软件,基于OpenMS软件开发的多伦多大学的汉斯·罗伊教授。
加里•Kruppa博士力量的副总裁蛋白质组学,解释道:“添加diaPASEF工作流是向前迈出的重要一步自下而上的蛋白质组学,在处理缺失值问题和改善标签免费量化(LFQ)。timsTOF Pro是快速获得声誉的交付使用短梯度增加报道的深度,并提供行业领先的健壮性由于其正交源和dual-TIMS漏斗设计。此外,肽CCS值获得timsTOF Pro是证明增加蛋白质的基础在diaPASEF工作流ID号,以及使用CCS match-between-runs ddaPASEF (MBR),为了进一步提高数据完整性和LFQ性能在低蛋白质丰度。我们要感谢我们的科学合作伙伴Drs。马提亚·曼Ruedi Aebersold、本·柯林斯和汉斯·罗伊大多数diaPASEF合作富有成果,于尔根·考克斯博士的优秀与MBR-ddaPASEF取得进一步进展。”
于尔根·考克斯博士,大组长的计算系统生物化学生物化学研究所Martinsried,说:“我们已经开发出一种高度并行的4 d timsTOF Pro数据集特征检测算法提取峰值组装同位素模式,其次是质量re-calibration使用非线性拟合的m / z,同时保留时间对齐,离子迁移率和信号强度。label-free蛋白的缺失值问题量化在许多样品现在可以大大减少MS1-level CCS-aware match-between-runs (MBR) 2,从而显著提高试验精度和准确性使用基准。”
4 d蛋白质组学的新耗材和软件
力量和PreOmics GmbH宣布共同发展和co-markting协议,将重点放在PreOmics timsTOF Pro是样品制备技术。inStageTip (iST)技术去除清洁剂,聚合物,盐、油脂和其他污染物,特殊肽复苏。新是协议使健壮和可再生的有大量的时间优势的样品制备(超过40小时保存)共同协议相比,在半自动是适用于集成,高通量样品准备。
Drs。Nils富农和加尔文Pichler PreOmics董事总经理说:“我们非常激动和力量的端到端工作流程,使蛋白质分析简单的更好,并与我们分享这些改进高度重视学术和生物制药全球各地的客户。我们相信timsTOF Pro的力量对4 d蛋白质组学是一个完美的比赛对我们是样品处理技术。”
为蛋白质组学软件,力量和Genedata宣布Genedata表现主义的合作软件平台,它现在支持timsTOF Pro 4 d组学格式。本机支持的最新timsTOF Pro简化和自动化的数据文件格式打开新的机遇最复杂的蛋白质组学,代谢组学和biotherapeutics表征研究。智能前体的力量选择深蛋白质组报道的速度梯度timsTOF Pro结合Genedata表现主义的可伸缩性和速度使下一代的实现宿主细胞蛋白(HCP)的分析平台。
生命科学软件经理彼得博士Hufnagel力量,扩大:“我们由api驱动开放数据文件格式哲学有助于加速采用timsTOF数据到许多重要的第三方软件解决方案。纳入Genedata表现主义是一个重要的一步要求相互HCP分析生物制药客户,这是快速通过Genedata由于我们开放文件格式的架构。”
业务部门主管马库斯博士Brosch Genedata表现主义,说:“Genedata表现主义®构建在其证明蛋白质组学能力识别和量化宿主细胞蛋白(学校)对检出限。它独特的支持范围广泛的HCP搜索和分析策略利用高性能的企业架构,提供前所未有的速度和可伸缩性要求处理大量复杂的蛋白质组学数据。不仅我们的共同客户现在可以自动化,加快HCP分析,但利用一个软件平台为所有他们的需求在蛋白质组学、代谢组学和biotherapeutics特征。”
新型超高灵敏度4 d Lipidomics工作流
基础上的成功MetaboScape®和CCSPredict™,力量宣布进步超高灵敏度4 d lipidomics工作流timsTOF Pro和timsTOF fleX平台,展示高通量,高灵敏度测量使用LC-TIMS-MS /女士。优化小说PASEF 4 d lipidomics方法现在允许的数量确定脂质在单发分析几乎翻了一倍,同时获得attomole敏感度。这个创新的工作流使用nanoLC-TIMS-PASEF量化大约500脂质高定量准确性和重现性从几千细胞,除了建立一个图书馆的1000多准确CCS值从人血浆,小鼠肝脏和人类癌细胞。
Florian迈耶博士,博士后研究员大生物化学研究所的资深作者study3,补充道:“我们的研究建立了4 d lipidomics和铺平了道路使用PASEF lipidomics更敏感。使用获得的精密度和准确度蒂姆斯可用于促进脂类的任务,除了全面的MS / MS PASEF生成的信息。此外,高精度CCS值提供依据机器学习技术来预测CCS值更准确和更广泛的脂质类”。
力量介绍了小说timsTOF fleXTM质谱计,包括适应software-switchable MALDI来源ESI timsTOF ProTM平台。这种新的ESI / MALDI功能允许在组学相结合,SpatialOMxTM,在一个乐器。timsTOF fleX有力量的专有10 khz SmartBeamTM三维激光与真正的像素富达快速,label-free MALDI成像高空间分辨率,在充分保留未经雕琢4 d蛋白质组学和phenomics敏感性ESI timsTOF Pro的模式。
这种独特的SpatialOMx方法,研究人员获得洞察空间分子分布在从MALDI成像,组织指导4 d组学分子表达的研究,如蛋白质,低级癌症抗原肽脂质、聚糖、代谢物,或外源性物质,不能观察到传统的染色或标签技术。MALDI-guided SpatialOMx允许针对特定的细胞为后续ESI-TIMS / PASEF-based群体或dia 4 d蛋白质组学或4 d lipidomics /代谢组学。两人现在可以执行在一个健壮的工具,timsTOF fleX,超高灵敏度的需要推进单细胞生物研究,作为一个完美的补充RNA-seq单细胞转录组。
蛋白质组学中心主任理查德·德雷克教授在南卡罗莱纳医科大学的,说:“我们的数据样本使用新的timsTOF fleX系统是前所未有的空间分辨率和多糖的深度报道。作为聚糖正在成为组织和血清中潜在的临床标记监控整体免疫状况,健康或不健康的老龄化,timsTOF flex的独特功能将极大地促进这些努力。timsTOF flex允许我们累积的方法开发了癌症和免疫疗法的组织和biofluid分析收敛在一个平台上。我可以看到无限类乐器的应用在许多研究领域快速多糖组织成像和biofluid 4 d组学分析”。
Rohan Thakur博士,执行副总裁力量Daltonics,补充道:“大多数组织蛋白质组学研究融合细胞的不同亚类,与一个不受欢迎的平均效应,掩盖了很多重要的生物学和病理学。MALDI-guided spatialOMx spatially-defined timsTOF fleX允许分析的组织区域,从而允许后续4 d蛋白质组学有选择地程控亚群体的目标。健壮,超高灵敏度timsTOF fleX桥梁之间的分裂分子组织成像和体液分析提供nanoLC-TIMS-MS /女士在同一仪器。这种独特的结合将使timsTOF fleX在4 d蛋白质组学的一个宝贵的研究工具和phenomics,以及推进单细胞生物,pharmaco-proteomics,平移4 d cross-omics工作流在大细胞数量或病人军团。”
力量也推出IntelliSlidesTM专门设计自动化timsTOF fleX工作流。IntelliSlides找pre-inscribed software-readable教标志的导电表面来表示将组织样本,条形码和跟踪号码。从示例加载IntelliSlides自动化去除效率低下的来源,因为他们本身就是正确地贴上标签,导向正确,MALDI图像配准发生在触摸一个按钮。用专门的软件,现在IntelliSlides MALDI成像对每个人来说都更容易。
此外,力量介绍SCiLS实验室2020 MALDI成像软件,现在结合MetaboScape5.0提供自动注释的脂质和代谢产物在spatialOMx组织分子图像。这种独特的组合自动匹配离子测量组织代谢组学和分子信息lipidomics工作流,强调生物相关通路信息使用MALDI成像。
博士丹尼尔·克鲁格,亥姆霍兹制药研究所助理教授萨尔(臀部)评论道:“我们用质谱和空间代谢组学在医药领域的研究。这包括特别是myxobacterial次生代谢物的分析小说天然产品。我们实验室多年来一直使用力量的仪器和软件,尤其是SCiLS实验室和MetaboScape。新的分子成像工作流集成这两种软件解决方案极大地简化和加快了整个MALDI成像管道。它将离子图像转化为分子影像与信心带注释的分子。”
新的工作流集成成像和代谢组学还支持数据从力量scimaX™mrm平台,以及新的timsTOF fleX。MetaboScape独特的霸王龙2 d算法进行特征提取,de-isotoping,离子反褶积谱图像数据集。在MetaboScape、分子功能注释是基于准确的质量和同位素富达使用SmartFormulaTM和分子信息,例如从公共数据库HMDB和LipidMaps等。MetaboScape现在也提供了独特的能力来增加ID得分信心通过整合准确商旅碰撞截面(CCS)从timsTOF分析。识别流回SCiLS实验室完全注释分子图像。SCiLS实验室是女士的市场领先的软件成像,而MetaboScape代谢物标记的识别软件解决方案的选择和路径映射……
b . 4 d蛋白质组学和4 d Phenomics创新
diaPASEF MBR-ddaPASEF 4 d蛋白质组学的进步
力量的革命timsTOF™Pro下一代nLC-TIMS-MS /女士4 d蛋白质组学已进一步加强PASEF结合data-indepedent (DIA)收购,在diaPASEF超高灵敏度自下而上的蛋白质组学。而无与伦比的频宽比视数据采集(DDA) PASEF显著提高灵敏度和深度报道使用短nanoLC运行时,基于块的随机性质导致缺失值,问题明显改善diaPASEF工作流、或match-between-runs ddaPASEF (MBR)。
这部小说diaPASEF1工作流,在asm 2019在制品可用于方法开发客户,使用重叠的窗口在离子迁移域触发MS / MS,有效地使用在高灵敏度四极离子传输的前身。通过使用PASEF的固有频宽比优势,新diaPASEF工作流通常导致了30%的性能提高,现在有超过7000的蛋白质中确定一个120分钟的单发实验200 ng希拉消化注入。数据分析,包括4 d功能对齐质量,保留时间,离子迁移率和强度,使用新的Mobi-DIK执行软件,基于OpenMS软件开发的多伦多大学的汉斯·罗伊教授。
加里•Kruppa博士力量的副总裁蛋白质组学,解释道:“添加diaPASEF工作流是向前迈出的重要一步自下而上的蛋白质组学,在处理缺失值问题和改善标签免费量化(LFQ)。timsTOF Pro是快速获得声誉的交付使用短梯度增加报道的深度,并提供行业领先的健壮性由于其正交源和dual-TIMS漏斗设计。此外,肽CCS值获得timsTOF Pro是证明增加蛋白质的基础在diaPASEF工作流ID号,以及使用CCS match-between-runs ddaPASEF (MBR),为了进一步提高数据完整性和LFQ性能在低蛋白质丰度。我们要感谢我们的科学合作伙伴Drs。马提亚·曼Ruedi Aebersold、本·柯林斯和汉斯·罗伊大多数diaPASEF合作富有成果,于尔根·考克斯博士的优秀与MBR-ddaPASEF取得进一步进展。”
于尔根·考克斯博士,大组长的计算系统生物化学生物化学研究所Martinsried,说:“我们已经开发出一种高度并行的4 d timsTOF Pro数据集特征检测算法提取峰值组装同位素模式,其次是质量re-calibration使用非线性拟合的m / z,同时保留时间对齐,离子迁移率和信号强度。label-free蛋白的缺失值问题量化在许多样品现在可以大大减少MS1-level CCS-aware match-between-runs (MBR) 2,从而显著提高试验精度和准确性使用基准。”
4 d蛋白质组学的新耗材和软件
力量和PreOmics GmbH宣布共同发展和co-markting协议,将重点放在PreOmics timsTOF Pro是样品制备技术。inStageTip (iST)技术去除清洁剂,聚合物,盐、油脂和其他污染物,特殊肽复苏。新是协议使健壮和可再生的有大量的时间优势的样品制备(超过40小时保存)共同协议相比,在半自动是适用于集成,高通量样品准备。
Drs。Nils富农和加尔文Pichler PreOmics董事总经理说:“我们非常激动和力量的端到端工作流程,使蛋白质分析简单的更好,并与我们分享这些改进高度重视学术和生物制药全球各地的客户。我们相信timsTOF Pro的力量对4 d蛋白质组学是一个完美的比赛对我们是样品处理技术。”
为蛋白质组学软件,力量和Genedata宣布Genedata表现主义的合作软件平台,它现在支持timsTOF Pro 4 d组学格式。本机支持的最新timsTOF Pro简化和自动化的数据文件格式打开新的机遇最复杂的蛋白质组学,代谢组学和biotherapeutics表征研究。智能前体的力量选择深蛋白质组报道的速度梯度timsTOF Pro结合Genedata表现主义的可伸缩性和速度使下一代的实现宿主细胞蛋白(HCP)的分析平台。
生命科学软件经理彼得博士Hufnagel力量,扩大:“我们由api驱动开放数据文件格式哲学有助于加速采用timsTOF数据到许多重要的第三方软件解决方案。纳入Genedata表现主义是一个重要的一步要求相互HCP分析生物制药客户,这是快速通过Genedata由于我们开放文件格式的架构。”
业务部门主管马库斯博士Brosch Genedata表现主义,说:“Genedata表现主义®构建在其证明蛋白质组学能力识别和量化宿主细胞蛋白(学校)对检出限。它独特的支持范围广泛的HCP搜索和分析策略利用高性能的企业架构,提供前所未有的速度和可伸缩性要求处理大量复杂的蛋白质组学数据。不仅我们的共同客户现在可以自动化,加快HCP分析,但利用一个软件平台为所有他们的需求在蛋白质组学、代谢组学和biotherapeutics特征。”
新型超高灵敏度4 d Lipidomics工作流
基础上的成功MetaboScape®和CCSPredict™,力量宣布进步超高灵敏度4 d lipidomics工作流timsTOF Pro和timsTOF fleX平台,展示高通量,高灵敏度测量使用LC-TIMS-MS /女士。优化小说PASEF 4 d lipidomics方法现在允许的数量确定脂质在单发分析几乎翻了一倍,同时获得attomole敏感度。这个创新的工作流使用nanoLC-TIMS-PASEF量化大约500脂质高定量准确性和重现性从几千细胞,除了建立一个图书馆的1000多准确CCS值从人血浆,小鼠肝脏和人类癌细胞。
Florian迈耶博士,博士后研究员大生物化学研究所的资深作者study3,补充道:“我们的研究建立了4 d lipidomics和铺平了道路使用PASEF lipidomics更敏感。使用获得的精密度和准确度蒂姆斯可用于促进脂类的任务,除了全面的MS / MS PASEF生成的信息。此外,高精度CCS值提供依据机器学习技术来预测CCS值更准确和更广泛的脂质类”。
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