陈BrainGlobe扎克伯格计划奖两笔赠款
BrainGlobe开源,社区驱动平台计算神经解剖学,陈被授予两笔赠款从扎克伯格倡议(CZI)。
“CZI的任务之一是加快科学进步通过支持变革的技术的发展。BrainGlobe适合这个愿景通过提供一个中央平台计算神经解剖学与其他工作包括napari易于使用和完整,“特洛伊Margrie说,塞恩斯伯里康中心副主任和co-PI CZI授予BrainGlobe。
的两笔赠款授予BrainGlobe CZI回应他们的要求申请napari插件加速器赠款。这个资金调用支持插件项目的推出napari图像分析平台,目的是生成一个可扩展的插件生态系统提供容易获得可再生的和定量bioimage分析。
“虽然非常复杂,napari本身已经非常有限的功能生物学家的目的是让人们开发插件生物应用程序,包括通用图像处理算法和更具体的应用程序,“说亚当•泰森Margrie实验室的前成员,现在科学研究所的软件导致癌症研究和co-PI CZI napari加速器授予BrainGlobe插件。
两笔赠款授予的第一个团队来帮助保持和发展现有的软件称为cellfinder,由BrainGlobe全脑成像数据的分析。cellfinder软件提供了一个新颖的方法在整个大脑细胞检测图像,从而使napari t级3 d细胞检测。被授予第二笔赠款,用于开发一个新的meta-plugin汇集多个不同的软件插件在BrainGlobe倡议(BGI)以便所有interoperative方式在一个工作环境。拨款都将允许BrainGlobe插件开发和维护社区,同时也使他们更强劲的资金具体开发时间。通过与伦敦大学学院合作科学计算这项工作的目标是在2022年7月完成。
除了资助自己,启动程序将启动与虚拟事件收集所有napari插件加速器的受让人在12月庆祝奖和相互联系和CZI。这将有助于建立受资助者之间的联系和进一步发展napari社区。
“虽然受资助者可能工作在不同的领域,从根本上很多图像分析最终下降到相同的方法。结合napari插件的加速器的受让人将有助于编写软件开发社区的人同样的平台,这将导致卓有成效的合作,也确保我们避免重复的努力,”亚当泰森。“很高兴看到所有的努力开始几乎十年前(指出)由不同的人包括基督教Niedworok和查理卢梭发展这些验证分析管道开放存取(BGI的旗帜下,现在坐),来实现。高的下载数量可能反映了急需这些工具已经导致有效的科学,”特洛伊Margrie说。
