CLSI指南提供了解释标准微生物鉴定DNA测序目标

临床和实验室标准协会(CLSI)最近发布的一个新文档,解释标准识别细菌和真菌的DNA测序目标;批准指南(MM18-A),为微生物提供最新的信息分类通过基因测序,特别强调解释和报告结果。

本文建立了系统方法指南分类广泛DNA测序的细菌和真菌。

指导所涉及的主题包括:

•选择DNA扩增和测序目标和目标的大小;

•建立质量控制参数的扩增和测序;

•测量序列的质量;

•评估的参考序列和数据库;

•识别序列的比较;

•建立由基因测序生成的身份解释标准分数;

•报告策略是微生物的临床相关的特定群体;和

•限制基因测序的微生物鉴定。

该准则指定建议临床实验室使用放大和Sanger-based (dideoxy-termination)广泛DNA的测序目标识别细菌、分枝杆菌、真菌培养临床分离株。

部分和全基因测序与16 s rRNA基因鉴定细菌和分枝杆菌,和内部转录间隔区区域ITS1和ITS2地区真菌的鉴定与包容的替代解决DNA在适当的目标。