致命的大肠杆菌病毒测序与罗氏GS初级系统由下丘脑-垂体-肾上腺轴的科学家

死亡的致命的大肠杆菌O104菌株数十数千欧洲住院已经使用454生命科学的台式测序GS初级测序系统生成“迄今为止最精确和详细的遗传分析”的特别致命的毒株。

序列是由英国健康保护局的科学家们和数据已经上传在国家生物技术信息中心(NCBI)网站使用的科学界。

结果表明,压力有一个独特的结合特性包含来自两种不同类型的大肠杆菌的基因,以及自己的基因。

测序组装显示应变包含两个染色体外的元素或质粒可能因素纳入其致病性。本质上,该大肠杆菌可能“拿起”一些额外的遗传物质。

”尽管这短读测序数据的可用性大肠杆菌疫情应变超过一个星期,简短的支离破碎的组装提供了有限的信息基因秩序和基因组成,“说Chinnappa Kodira,基因组学主任454生命科学。

Kodira继续说道,“这么长时间连续装配使更好的基因组结构特征,水平基因转移和致病性岛的关键理解新的毒性菌株的出现。”

添加这个新的长从GS初级读取序列数据系统提供社区迄今为止最连续的序列,并提供一个全面的基因组分析可以执行后续装配。

长长的猎枪读取使用454测序系统生成允许HPA科学家将几乎整个基因组组装成一个全面和详细的基因组地图在数小时内的病原体。

序列数据将协助持续努力确定疫情的源头,并理解压力可能是如何进化的。

”相结合的快速周转时间和高质量、长测序读使GS初级理想的研究平台,快速和全面的全基因组分析小说病原体疫情情况,”克里斯托弗·麦克劳德说,总裁兼首席执行官454生命科学。“我们欣慰,454生命科学有助于改善医疗保健,使一个快速反应,阐明潜在流行病。”