新兴的应用Bio-Rad滴数字™PCR技术

在第二届数字PCR人机交互会议上在圣迭戈,CA, 10月7号到9号,2013年,12个科学家使用Bio-Rad滴数字PCR系统将突出ddPCR拥有先进的他们的研究的应用程序。这些研究人员将分享ddPCR技术如何提供更精确、重现性、灵敏度比实时PCR方法在应用程序包括目标的量化和检测基因组拷贝数变异等改变,罕见的癌症突变。

在过去,为这样的应用程序开发工具已经被他们的有限精度不足和/或缺乏敏感性检测稀有物种。但由于ddPCR技术,研究人员现在可以专注于这些“大海捞针地从”的问题。不到两年以来Bio-Rad ddPCR系统带到市场,他们的应用程序导致了近50同行评议的出版物引用技术。

ddPCR技术的优势已经对医学研究产生了重要影响。

“艾滋病社区,例如,得益于ddPCR更敏感的测量的能力,也取决于它的属性增加精度,”乔治·Karlin-Neumann说科学事务主任Bio-Rad生物学中心的数字。”有更大的敏感性下降到非常低的水平取决于能够区分从无到有。你需要一个系统,本身已经非常低的噪音。”

液滴数字PCR检测残余艾滋病毒DNA是一个敏感的工具
临床潜在的一个很好的例子ddPCR系统是马特的工作应变和道格拉斯Richman艾滋病研究中心的加州大学圣地亚哥医学院在HIV病毒检测技术的性能进行验证。随后,与黛博拉Persaud巴尔的摩的约翰霍普金斯儿童医学中心的研究人员使用的技术证明婴儿出生与艾滋病毒功能治愈。

在最近的一次生物学技术播客,应变博士说,ddPCR化验证明精密度和准确度增加整个动态范围相对于实时PCR分析,特别是在较低的数字。此外,每滴样本的总成本数字PCR检测不到至少10到100倍的旧芯片数字PCR系统。

“当你谈论因素一百或更多的费用,实在是没有任何比较,”博士说。

理查德博士将信息使用ddPCR来检测潜在的艾滋病病毒,包括分析罕见事件在大量的细胞和检索临床相关数据。

看到滴数字PCR诊断的未来
Hanlee为首的研究小组,斯坦福大学医学院的助理教授,重点是平移和临床癌症遗传学的问题,一旦回答,有可能改善癌症病人的治疗。研究人员已经开发出许多癌症基因组的准确的审讯方法,克服各种挑战与临床样本和基因变异导致肿瘤的进化。在这种努力,液滴数字PCR是他们的主要工具之一。

“滴数字PCR加速了我们的发现,”吉博士说。”由于其使用方便,性能优越的精度,快速发展小说化验,液滴数字PCR一再表明其庞大的公用事业和未来潜力诊断应用程序。”

霁博士将讨论使用ddPCR技术跟踪,扩张,和失踪的致病基因变异在癌症、传染病和其他人类疾病随着时间的推移,还将讨论技术高度信息诊断的潜力。他现在使用Bio-Rad最近推出的第二代ddPCR乐器,在QX200™滴数字PCR系统,唯一的数字PCR系统与dna结合蛋白染料和TaqMan探测化学反应。

吉姆Huggett,会议的主讲人,是数字的作者MIQE (dMIQE)指南,科学家LGC(英国指定国家测量研究所化学和生物分析测量),和一个QX100™系统用户。其他客户在会议上展示包括大卫·多德德克萨斯大学的西南;莱昂纳多ibsen Pinheiro澳大利亚的国家计量研究院;罗斯·海恩斯的美国国家标准与技术研究院;加州大学戴维斯分校的维姬黄;弗林德斯大学的亚历克莫理和第一篇论文的合著者使用数字PCR;基思•杰罗姆·华盛顿大学的;加里•李Sangamo生物科学;萨比特Sankar MolecularMD;唐娜·沙利文的密西西比大学医学中心。

Bio-Rad应用科学家也会给谈判新兴应用程序使用ddPCR技术包括小分子核糖核酸、单细胞基因表达、基因连锁,多路复用,EvaGreen应用,新一代测序数据和验证。