重大的科学发现通过在定量蛋白质组学技术的进步在asm 2016
等压质量标记的相对定量蛋白质高通量,精确的方法用于研究生物系统中的蛋白质动力学。细胞生物学家、药物发现和癌症研究人员进行高通量定量蛋白质组学,在机构,包括马萨诸塞州综合医院、哈佛医学院,不列颠哥伦比亚大学和剑桥大学,使用多路复用定量利用等压标签,如热科学TMT10plex等压质量标签和先进的分析仪器,更好地了解时间、疾病和环境影响蛋白质组。
研究人员采用了使用新串联的质量标签(TMT)和同步前体选择(SPS) MS3工作流来准确地量化大量蛋白质的含量变化来回答复杂的生物学问题。
•教授珍妮·t·李和威廉•哈斯和他们的团队在马萨诸塞州总医院和哈佛医学院一起描述Xist interactome。他们开发了一个RNA-centric蛋白质组学的方法,包括使用TMT-based多元定量识别蛋白质与Xist交互,沉默的非编码RNA参与X chromosomes.1之一
“使用10丛TMT标签在我们的蛋白质组学研究有助于缩小差距和高通量基因组方法,”哈斯说,哈佛医学院助理教授。“Orbitrap融合质谱仪提供准确性和宽动态范围,同时保持吞吐量,使我们比较更多的样品在一个实验中,从而增加了统计力量。”
•在最近的另一个研究中,来自英属哥伦比亚大学的研究人员采用了TMT终端胺同位素标记的基质(反面)工作流来确定新的MALT1基质,淋巴瘤的重要药物的目标。使用唯一已知的B细胞生活MALT1突变纯合子患者,研究人员对细胞进行比较蛋白质组分析从他健康的家庭成员。使用一个SPS MS3方法,团队能够执行非常准确分析TMT记者离子比率,使他们能够识别HOIL1作为一种新的MALT1衬底。2
“第一次,我们仅使用蛋白质组学研究的表型患者自身免疫性疾病和识别缺陷,”克里斯博士说总的来说,原则调查员,血液研究中心,英属哥伦比亚大学。“与10丛TMT-labeling,你有10个机会来放大信号(MS1)和检测低丰度蛋白,可能错过。”
•凯瑟琳Lilley教授剑桥中心主任蛋白质组学剑桥大学的英国使用高通量定量蛋白质组学产生高分辨率亚细胞蛋白质地图。博士Lilley适用方法称为LOPIT-Localization蛋白质的利用等压标记识别蛋白质,和使用细胞器标记来定义集群硝唑的蛋白质。这提供了一种稳态分布在细胞器和蛋白质促进小说细胞器蛋白质的鉴定。该方法结合TMT10plex标签,分析与准确的SPS MS3分析样品,和发展中产生的信息工具来管理复杂的数据允许Lilley博士”hyper-plex LOPIT。“她是使用这个更高的多路复用方法开发一个全面的细胞自我更新的地图老鼠胚胎干细胞。3
TMT技术的有效利用已经成为可能,通过最近的,先进的分析仪器的进步,包括开发的SPS MS3方法热科学Tribrid质谱仪,热科学Orbitrap融合和热科学Orbitrap lumo融合。
TMT结合SPS MS3增加记者离子信号强度允许准确和精确的多路复用定量不相消干涉co-isolated物种共同挑战与产品离子多路复用的方法。科学家可以快速监测多达10个条件同时获得非常high-throughput-tens成千上万的准确量化肽在短至24小时。
在过去三年里这个新技术使得高素质,生物研究,导致30多个同行评议的文章发表在一些最著名的科学期刊。
