从固态Nanodetectors一家将DNA序列数据
一家公司宣布首次直接证明数据电子重排序和映射的DNA将会在一年一度的基因组生物学和技术的进步(AGBT)会议,2月15到18,马可岛,佛罗里达州。组学和个性化医疗会议的欧洲分子生物学实验室(EMBL), 2月16日至18日,德国海德堡。
一家的位置测序平台独特的揭示了DNA序列的身份和位置信息通过直接电检测探针绑定到单个分子可能多达数百个碱基长度。取决于部署方法,平台可用于分析的全尺寸规模DNA变异,包括单碱基序列,解决大规模基因组结构变异,染色体非整倍性,上面的任意组合。
“显著改善了过去几年的速度、吞吐量和成本产生DNA序列信息,为应用测序技术创造极大的热情在诊所,”巴雷特Bready说,医学博士公司的首席执行官一家。“虽然这些进步给人留下了深刻的印象,而且重要的是,许多应用程序序列数据——在医学以及在基础生物研究和农业——需要类似水平的提高数据准确性、信息内容,简化数据和计算负担,和简化工作流程。数据我们展示AGBT EMBL展示什么是可能的和纯固态检测。这些数据提供了深入了解一家位置测序平台,一旦扩大,有可能设立新的DNA序列分析性能标准和开放新市场。”
相比其他方法称为“纳米孔测序”位置排序并不试图区分单个核苷酸碱基通过电子探测器。相反,一家方法涉及到的短的寡核苷酸探针杂交很长的DNA模板,通过通过固态nanodetectors probe-bound模板,和电子检测杂交探针的位置。结合许多这样的探测器的位置信息,可以创建详细的基因组地图与稀疏的调查报道,或真正的新创的密集的大型基因组序列探针覆盖。
位置排序不需要减缓DNA通过nanodetectors易位率。信息可以迅速产生了前所未有的长度尺度的方法本质上是有针对性的,量化,包括一个简单的工作流。使用固态nanodetectors提供了基础平台,是高度可伸缩的,潜力巨大的吞吐量的进步,极大地降低了数据的负担和高容量的制造业。
提出将演示数据,一家nanodetector设计和DNA制备技术支持:
分析单个DNA分子50 kb的长度
映射的探测精度,大大超过了光的衍射极限
重排序的目标区域捕获或浓缩步骤
分析基因组结构变异