未来一代测序调查结果:方法、挑战和采购方面的考虑

下一代测序(门店),也被称为高通量测序,笼统的术语用来描述不同的现代测序技术如Illumina公司(Solexa), 454年罗氏,离子激流和固体。以其前所未有的吞吐量、可伸缩性和速度,下一代测序可以让研究人员研究生物系统在一个前所未有的水平。

188金宝搏备用技术网络最近进行了一项调查,以便更好地理解研究人员如何使用门店,他们所面临的挑战以及他们的新仪器。选择下面的调查可以发现的结果。

研究人员使用或计划使用的方法在未来12个月内:

转录组(RNA-Seq)	74.6%
全基因组测序	59.0%
Chip-Seq	35.3%
新创测序	32.8%
Methyl-Seq	29.6%

在g,平均每周由实验室产生的数据量:

< 100	47.5%
100 - 499	33.6%
500 - 1499	8.2%
1500 - 2999	2.5%
3000 - 5999	1.6%
6000 - 11999	1.6%
12000 +	5.0%

83%的受访者告诉我们,他们使用paired-end测序。他们的原因是:

有效样本用	40.6%
简化数据分析	34.7%
其他	12.9%
简单的工作流	11.9%

当使用挥动的五大挑战是:

1。成本

2。数据分析

3所示。样品质量

4所示。数据存储

5。图书馆准备

阅读更多关于数据在生命科学领域的挑战。

当被问及会帮助他们克服这些挑战,研究人员回答说:

1。更好地获取bioinformaticians

2。自动化

3所示。更好的培训

4所示。新设备

5。更多的员工

6。对数据的访问伙伴关系计划

7所示。更多的工具

三大因素影响门店购买的仪器:

1。数据的准确性

2。耗材价格

3所示。仪器的价格

考虑一个新的购买,三大影响购买的因素有:

1。减少运行时间

2。增加最大数据输出

3所示。增加最大读长度