油气痕迹的扩大门店癌症面板使基因测序的困难
牛津基因技术(油气痕迹),分子遗传学公司已扩大其SureSeq myPanel™挥动定制癌症面板内容。扩张有响应为研究变得越来越重要,越来越多的癌症类型,和需要获得可靠数据difficult-to-sequence基因和突变。扩大内容覆盖了70个基因,与更多的可用在不久的将来,优化血液学和固体肿瘤包括乳腺癌、结肠癌、肺癌、卵巢癌和前列腺癌,神经胶质瘤,黑色素瘤,肉瘤,白血病,骨髓增殖性肿瘤和骨髓增生异常综合征。
油气痕迹的hybridisation-based诱饵设计的力量加上其独特的专业知识提供出色的整个基因覆盖,无与伦比的均匀性和序列的能力即使是最困难的地区。这就产生可再生的和有意义的数据,使研究人员确信测序结果和分析。
一些最困难的癌症相关的基因序列是那些有高水平的GC-rich内容,如肿瘤抑制基因在急性髓系白血病CEBPA,经常和TP53突变在许多癌症类型包括乳腺癌。此外,内部串联重复基因包含具有挑战性目标由于其重复的性质和长度。面板可以从其他供应商可以体验问题数据可变性,覆盖退学或掩盖了这些区域的突变。相比之下,油气痕迹的创新诱饵设计独特的克服这些问题,提供所需的高水平的均匀覆盖,减少了需要补充填写Sanger测序。
这种独特的设计允许研究人员检测低频变异一直下降到1% VAF等位基因频率(变体)阅读的深度> 1000 x。面板完全customisable-researchers可以选择基因,其实或intronic内容需要创建一个门店癌症面板,满足他们的需求。所有内容完全pre-optimised,消除需要冗长的内部优化,减少试验开发时间。
安娜Skowronska博士研发西米德兰地区遗传学实验室,科学家已经使用SureSeq骨髓面板内容。她说:“我们发现SureSeq面板执行很好,发现所有已知阳性与一个优秀的变异检测1%左右的…我们积极惊讶的从第一个分析水平的突变检测可以实现的。”
油气痕迹与权威专家密切合作,检查当前文学提供所有相关的最新的目标区域。这包括其实,intronic和拼接网站,提供全面的洞察disease-driving突变。高级产品经理戴夫•库克在油气痕迹阐述:“我们不断努力扩大我们的定制挥动面板内容来确保我们有最近和相关内容。市场覆盖率和再现性是无与伦比的,我们想扩大门店质量数据的可访问性和地区更广泛的癌症类型包括基因序列已知的很难。我们致力于帮助客户达到他们的目标,我们高兴地报告,我们的专业知识使我们能够克服这些测序困难,给他们更多的信心数据生成”。
