Premier Biosoft发布AlleleID 2.00版本
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Premier Biosoft International宣布发布AlleleID 2.00版本。AlleleID帮助设计用于检测病原体或细菌的微阵列和qPCR诊断分析。
典型的应用包括环境监测、预防/控制传染病、发展监测试验和生物多样性研究。
为了设计物种鉴定分析,AlleleID对序列进行比对并分析物种特定区域,以设计用于微阵列的探针和用于TaqMan的引物和探针®/分子信标qPCR检测。
这些测定的目的是只从混合物中检测出感兴趣的菌株或物种。
对于跨物种分析,AlleleID识别相关生物的保守区域,以帮助研究所研究生物的基因组草图不可用时的基因表达。它为污染物的影响等研究提供了分类群特定的设计。
Premier Biosoft声称,AlleleID采用复杂的算法来设计特定和高效的引物和探针。它BLAST搜索序列并自动解释结果,以设计特定的寡核苷酸,避免同源区域。
该程序包含了一个称为“最小集”的功能,它设计了检测所需的最少数量的寡核苷酸。
该计划也有广泛的支持qPCR化学,如SYBR®绿色,TaqMan®, FRET探针和信标等位基因辨别,多重和免疫分析。
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