总理Biosoft AlleleID发布版本4
总理Biosoft国际宣布世界广泛发布版本4 AlleleID的工具用于设计诊断化验实时PCR和微阵列。
AlleleID现在包括支持为拼接设计探针变体数组。检测可变剪接事件,AlleleID设计两种类型的探测器称为结探针和intra-exon调查。
连接探针跨度exon-exon边界而intra-exon探测谎言完全在一个外显子,使AlleleID的有效工具在设计实验来测试接头形式。
除了设计单模板和多路复用实验版本4包括支持设计的物种鉴定和分类群歧视化验实时PCR SYBR等化学反应®绿色,TaqMan®和TaqMan®MGB(小沟绑定)。
“AlleleID可以有效地用于发展分析生物防御、环境监测、预防和控制非传染病监测测试的发展和生物多样性研究,”凯布朗说,业务开发和市场营销副总裁。
“我们很高兴能如何AlleleID已经收到由世界各地的研究者。我们很自豪组织如FDA、疾控中心和农业部为我们的客户”。
设计物种识别化验,AlleleID对齐序列使用ClustalW并分析守恒和物种特定区域为微阵列设计分子探针和TaqMan®/分子信标实时PCR检测。
化验是用来检测应变或物种的兴趣。跨物种化验,AlleleID标识守恒的区域相关的生物,可以用样本的任何生物。
这个功能也可以用于检测、识别、量化的污染物。
“最小集”,AlleleID的特性之一,帮助设计引物和探针的最少数量,确定每个所需的物种/压力/分类单元的组合。
类群或交叉物种化验,这个特性非常有用当组或分类单元高度不同。
部分组预先设计或出版组引物,AlleleID可以设计兼容的引物和探针序列的物种或类群特异性。
AlleleID雇佣了一个复杂的算法来保证试验成功。特定的寡核苷酸的设计是通过避免地区显著的同源性搜索结果发现通过自动解释爆炸。
设计的寡核苷酸可以搜索,以验证他们的特异性。底漆的效率会提高通过自动避免模板的二级结构。