蛋白质森林的质谱结果分析工具待评估

马萨诸塞州剑桥市的怀特海研究所、哈佛医学院和马萨诸塞大学医学院的蛋白质组学和质谱设施正在评估MSRAT。

这些机构将使用生物信息学软件，快速发现使用数字ProteomeChip™(dPC™)系统产生的数据的丰富性。这些研究包括神经胶质肿瘤生物标志物的发现，尿液中前列腺癌标志物的鉴定，以及从T细胞中研究疾病相关的MHC I类和II类多肽。

“MSRAT是一款非凡的软件。该软件使我们能够以前所未有的方式分析我们的研究数据，并且大大减少了工作量和时间，”哈佛医学院整形外科助理教授、波士顿儿童医院蛋白质组学中心行政主任Keith R. Solomon博士说。

MSRAT™生物信息学软件是为生物学家开发的，可帮助他们快速发现蛋白质组学数据中的新发现。该软件最大限度地提高了他们通过基于MS/MS的蛋白质组学研究将蛋白质表达、翻译后修饰和pI异构体与疾病联系起来的能力。此外，该软件在几分钟内分析大量的质谱仪数据，使研究人员能够快速关注样本之间的差异/相似之处。该软件还提供可视化工具，如直方图、维恩图、微分热图和虚拟2D凝胶图，以协助对MS数据进行有意义的解释。最终，该软件使研究人员能够从他们的蛋白质组学实验中快速识别重要的生物学相关特征。